174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2771 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  47.81 
 
 		 1299 aa  1172    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  40.04 
 
 		 1372 aa  915    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  46.62 
 
 		 1443 aa  720    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  47.53 
 
 		 1304 aa  1188    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  71.55 
 
 		 1401 aa  1878    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  40.18 
 
 		 1372 aa  918    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  39.88 
 
 		 1360 aa  885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  39.42 
 
 		 1375 aa  911    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  46.86 
 
 		 1435 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  100 
 
 		 1392 aa  2765    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  38.93 
 
 		 1448 aa  962    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  41.23 
 
 		 1346 aa  905    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  40.33 
 
 		 1347 aa  885    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1360 aa  877    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1358 aa  873    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  40.26 
 
 		 1347 aa  884    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1347 aa  884    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1372 aa  917    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1372 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1372 aa  910    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1372 aa  917    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1372 aa  917    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  47.46 
 
 		 1304 aa  1193    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  28.42 
 
 		 1243 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1056 aa  342  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  27.76 
 
 		 1426 aa  340  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1332 aa  334  6e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.31 
 
 		 1359 aa  240  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1434 aa  237  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1453 aa  231  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1218 aa  228  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1453 aa  211  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1292 aa  205  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1346 aa  204  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  28.69 
 
 		 1378 aa  203  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1361 aa  201  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1380 aa  201  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1473 aa  192  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1443 aa  182  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1352 aa  161  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1232 aa  154  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.05 
 
 		 1285 aa  143  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  24.26 
 
 		 1382 aa  143  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  23.95 
 
 		 1285 aa  140  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1221 aa  139  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1308 aa  135  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1221 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1224 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1206 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1325 aa  127  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1226 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  24.43 
 
 		 1246 aa  124  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1223 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1224 aa  123  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  26.23 
 
 		 1485 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1377 aa  121  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.81 
 
 		 1485 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1265 aa  119  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1299 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1340 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1262 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1224 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1273 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1229 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.04 
 
 		 1273 aa  114  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.31 
 
 		 1184 aa  112  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1184 aa  112  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1259 aa  111  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1259 aa  110  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1258 aa  109  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1259 aa  108  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1259 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  23.65 
 
 		 857 aa  107  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1283 aa  107  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1310 aa  106  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1259 aa  106  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1259 aa  106  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.61 
 
 		 1259 aa  105  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  23.06 
 
 		 1025 aa  105  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1254 aa  105  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1174 aa  105  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1773 aa  105  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1304 aa  102  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1344 aa  102  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  28.38 
 
 		 1344 aa  101  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1341 aa  101  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1344 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1290 aa  99.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1664 aa  99  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1255 aa  99.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1319 aa  99  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1319 aa  98.6  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1305 aa  96.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1226 aa  96.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1664 aa  95.9  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1290 aa  95.5  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  23.24 
 
 		 929 aa  95.1  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  23.24 
 
 		 929 aa  95.1  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  25.45 
 
 		 1507 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1451 aa  94  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>