147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1509 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 1664 aa  3355    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  95.61 
 
 		 1664 aa  3200    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  56.43 
 
 		 1773 aa  1324    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1232 aa  296  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1223 aa  296  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1226 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1224 aa  296  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1221 aa  294  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1229 aa  293  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1224 aa  291  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1224 aa  289  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25 
 
 		 1221 aa  288  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1283 aa  288  7e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1226 aa  286  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1206 aa  286  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1265 aa  279  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  24.95 
 
 		 1246 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1319 aa  273  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1258 aa  266  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1340 aa  265  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  24.04 
 
 		 1342 aa  263  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  23.4 
 
 		 1249 aa  261  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1259 aa  257  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1305 aa  257  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1259 aa  257  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1259 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1256 aa  257  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1259 aa  255  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1312 aa  255  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1291 aa  255  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.16 
 
 		 1259 aa  255  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1259 aa  255  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1259 aa  254  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1259 aa  253  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1259 aa  253  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1259 aa  253  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1259 aa  252  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1255 aa  252  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1259 aa  251  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1254 aa  249  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  22.78 
 
 		 1254 aa  244  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1174 aa  240  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  23.15 
 
 		 857 aa  239  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1290 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1259 aa  234  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1290 aa  226  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1299 aa  225  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1174 aa  222  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1385 aa  222  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1304 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1305 aa  213  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1402 aa  212  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1344 aa  210  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1355 aa  209  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1449 aa  208  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1344 aa  208  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1398 aa  207  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1341 aa  207  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1328 aa  205  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  23.81 
 
 		 1344 aa  204  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1352 aa  199  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  22.78 
 
 		 1382 aa  199  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1297 aa  193  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1319 aa  191  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1302 aa  187  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1310 aa  186  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  21.02 
 
 		 1262 aa  165  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1353 aa  162  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1273 aa  151  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  23.59 
 
 		 1273 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.54 
 
 		 1285 aa  151  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  24.1 
 
 		 1285 aa  145  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  20.88 
 
 		 982 aa  120  3e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  23.26 
 
 		 1025 aa  118  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1308 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1056 aa  104  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  24.83 
 
 		 846 aa  104  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  25.29 
 
 		 846 aa  104  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.62 
 
 		 929 aa  102  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  24.84 
 
 		 929 aa  102  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1325 aa  101  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1448 aa  96.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1401 aa  93.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1435 aa  92.8  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  24.94 
 
 		 1443 aa  92  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1377 aa  87.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  22.96 
 
 		 1485 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1218 aa  86.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1392 aa  85.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1292 aa  85.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1358 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  22.6 
 
 		 1485 aa  84  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1360 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1443 aa  82  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1360 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1375 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1434 aa  79.7  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1346 aa  79.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1372 aa  79  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>