162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1014 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  45.34 
 
 
1299 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  44.98 
 
 
1304 aa  686    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  59.42 
 
 
1372 aa  1636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  46.86 
 
 
1401 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  59.45 
 
 
1372 aa  1632    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  69.45 
 
 
1360 aa  1156    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  44.85 
 
 
1304 aa  686    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  59.42 
 
 
1375 aa  1628    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  88.09 
 
 
1435 aa  2404    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  43.09 
 
 
1392 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  69.09 
 
 
1347 aa  1150    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  69.21 
 
 
1347 aa  1151    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  58.98 
 
 
1358 aa  1583    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  68.97 
 
 
1347 aa  1149    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1443 aa  2876    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  59.59 
 
 
1372 aa  1636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  59.59 
 
 
1372 aa  1636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  68.2 
 
 
1360 aa  1129    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  59.59 
 
 
1372 aa  1637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  59.59 
 
 
1372 aa  1636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  69.97 
 
 
1448 aa  2028    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  60.23 
 
 
1346 aa  1602    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  52.04 
 
 
1372 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  31.52 
 
 
1243 aa  316  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  30.77 
 
 
1056 aa  310  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  30.06 
 
 
1426 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  32.05 
 
 
1218 aa  225  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  25.55 
 
 
1332 aa  224  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  29.09 
 
 
1359 aa  215  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  29.43 
 
 
1346 aa  208  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  28.47 
 
 
1453 aa  194  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  27.7 
 
 
1361 aa  193  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  30.99 
 
 
1292 aa  192  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  27.48 
 
 
1443 aa  188  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  27.13 
 
 
1378 aa  186  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  26.65 
 
 
1380 aa  185  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  31.54 
 
 
1434 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.64 
 
 
1473 aa  184  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  28.24 
 
 
1453 aa  174  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.43 
 
 
1352 aa  148  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  26.13 
 
 
1262 aa  127  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25.3 
 
 
1308 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.24 
 
 
1221 aa  121  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.62 
 
 
1344 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.17 
 
 
1344 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.8 
 
 
1232 aa  116  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  24.05 
 
 
1341 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  24.72 
 
 
1259 aa  115  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  24.72 
 
 
1259 aa  115  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  23.85 
 
 
1259 aa  115  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  24.6 
 
 
1259 aa  115  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  24.6 
 
 
1259 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25 
 
 
1221 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  24.43 
 
 
1344 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  24.14 
 
 
1025 aa  112  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  25.39 
 
 
1319 aa  112  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  24.66 
 
 
1258 aa  108  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  22.81 
 
 
1382 aa  105  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  23.92 
 
 
1226 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.86 
 
 
1325 aa  103  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  23.44 
 
 
1305 aa  103  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  26.15 
 
 
1290 aa  103  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.57 
 
 
1340 aa  102  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.8 
 
 
1377 aa  101  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.05 
 
 
1485 aa  101  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.18 
 
 
1229 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.26 
 
 
1259 aa  99.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  23.94 
 
 
1342 aa  99.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  23.26 
 
 
1259 aa  99  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.01 
 
 
1259 aa  99  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  23.26 
 
 
1259 aa  99  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  23.19 
 
 
857 aa  99  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.26 
 
 
1259 aa  99  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.26 
 
 
1259 aa  98.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  25 
 
 
1223 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  26.27 
 
 
1254 aa  97.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  22.38 
 
 
1299 aa  97.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.01 
 
 
1259 aa  95.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  22.84 
 
 
1485 aa  95.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  23.08 
 
 
1254 aa  95.1  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.42 
 
 
1319 aa  95.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  27.66 
 
 
1224 aa  94  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.46 
 
 
1224 aa  94  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.13 
 
 
1259 aa  93.6  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  23.08 
 
 
1402 aa  93.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  23.56 
 
 
1449 aa  93.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  27.06 
 
 
1224 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  27.44 
 
 
1206 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  25.39 
 
 
1664 aa  92.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  24.94 
 
 
1664 aa  91.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  23.46 
 
 
1385 aa  91.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  23.41 
 
 
1290 aa  90.9  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  26.62 
 
 
1283 aa  90.9  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  23.79 
 
 
1398 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  27.6 
 
 
1285 aa  90.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  23.38 
 
 
1246 aa  89.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  29.41 
 
 
1226 aa  89.4  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  28.77 
 
 
1310 aa  88.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  24.16 
 
 
1249 aa  86.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.26 
 
 
1297 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>