157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2688 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  43.41 
 
 		 1385 aa  1098    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 1290 aa  2611    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  39.94 
 
 		 1355 aa  943    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  51.62 
 
 		 1402 aa  833    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  43.9 
 
 		 1398 aa  1147    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  42.18 
 
 		 1304 aa  1080    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  45.47 
 
 		 1449 aa  1002    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  43.46 
 
 		 1297 aa  1075    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1341 aa  1191    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  50.77 
 
 		 1299 aa  1297    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  47.53 
 
 		 1305 aa  1231    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  45.49 
 
 		 1344 aa  1191    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  62.67 
 
 		 1319 aa  1670    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  46.88 
 
 		 1353 aa  1179    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  45.41 
 
 		 1344 aa  1188    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  45.72 
 
 		 1344 aa  1195    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1259 aa  443  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1259 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1259 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1259 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1259 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1259 aa  434  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1259 aa  435  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  26 
 
 		 1259 aa  432  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  25.98 
 
 		 1259 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  26 
 
 		 1259 aa  433  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  26 
 
 		 1259 aa  431  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1259 aa  433  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1259 aa  428  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  26.75 
 
 		 1246 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1258 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1254 aa  412  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  25.9 
 
 		 1249 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1265 aa  407  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1256 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  26.54 
 
 		 1254 aa  400  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1290 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1291 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1310 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1283 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1305 aa  369  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  26.62 
 
 		 1342 aa  365  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1340 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1312 aa  352  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1223 aa  349  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1206 aa  343  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1224 aa  342  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1224 aa  337  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  27.63 
 
 		 857 aa  336  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1328 aa  325  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1174 aa  322  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1232 aa  321  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1224 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1259 aa  317  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1319 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1221 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1221 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1226 aa  291  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1229 aa  283  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1226 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1773 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1255 aa  243  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  25 
 
 		 1174 aa  240  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1664 aa  237  9e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1352 aa  236  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1664 aa  229  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1262 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  23.1 
 
 		 1382 aa  209  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1302 aa  197  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  24.24 
 
 		 1025 aa  189  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  22.53 
 
 		 982 aa  153  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23.46 
 
 		 1285 aa  149  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1273 aa  137  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  22.7 
 
 		 1273 aa  137  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1325 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1377 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  20.96 
 
 		 1285 aa  123  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1184 aa  121  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  26.75 
 
 		 1184 aa  121  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1308 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  25.33 
 
 		 846 aa  118  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  23.46 
 
 		 929 aa  117  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  23.25 
 
 		 929 aa  116  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  25.62 
 
 		 846 aa  115  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  22.82 
 
 		 1485 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1256 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.13 
 
 		 1485 aa  108  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1453 aa  107  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1361 aa  103  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  24.48 
 
 		 1426 aa  99  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1401 aa  95.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1473 aa  95.1  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1346 aa  95.1  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  23.43 
 
 		 1378 aa  94.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1434 aa  93.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  23.41 
 
 		 1443 aa  91.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1346 aa  90.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1358 aa  90.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1380 aa  89.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1360 aa  90.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>