156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2113 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 1385 aa  2816    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  41.27 
 
 		 1355 aa  1040    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  79.48 
 
 		 1402 aa  2172    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  79.76 
 
 		 1398 aa  2170    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  46.74 
 
 		 1304 aa  1273    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  78.1 
 
 		 1449 aa  2191    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  45.35 
 
 		 1297 aa  1152    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  67.27 
 
 		 1344 aa  1857    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  67.36 
 
 		 1341 aa  1857    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  42.15 
 
 		 1299 aa  1081    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  68.99 
 
 		 1305 aa  1879    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  67.56 
 
 		 1344 aa  1863    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  43.23 
 
 		 1319 aa  1197    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  42.89 
 
 		 1353 aa  1087    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  67.63 
 
 		 1344 aa  1869    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  43.41 
 
 		 1290 aa  1124    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1256 aa  422  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  26.37 
 
 		 1342 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1291 aa  412  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1340 aa  406  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1305 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1259 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1259 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1259 aa  403  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1259 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1312 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1259 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  26.37 
 
 		 1259 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1258 aa  400  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1259 aa  399  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1259 aa  397  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1259 aa  396  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1259 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1259 aa  397  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1259 aa  392  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1259 aa  390  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1310 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1283 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1254 aa  368  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1290 aa  370  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  25.02 
 
 		 1249 aa  364  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  24.53 
 
 		 1246 aa  363  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1265 aa  345  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  24.47 
 
 		 1254 aa  344  7e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1319 aa  332  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  27.25 
 
 		 857 aa  308  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1259 aa  275  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1224 aa  274  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1224 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1206 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1224 aa  271  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1223 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1328 aa  265  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1226 aa  262  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1174 aa  261  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1221 aa  255  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  27 
 
 		 1229 aa  254  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1221 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1352 aa  244  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1174 aa  239  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1232 aa  237  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1226 aa  234  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25 
 
 		 1255 aa  232  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1664 aa  229  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1664 aa  227  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1302 aa  221  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1773 aa  215  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  23.8 
 
 		 1382 aa  210  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24 
 
 		 1262 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  23.27 
 
 		 982 aa  158  7e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  28.44 
 
 		 1025 aa  153  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  21.71 
 
 		 1285 aa  124  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1273 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.29 
 
 		 1273 aa  116  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1401 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  22.06 
 
 		 1285 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1308 aa  113  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1325 aa  112  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  30.58 
 
 		 1243 aa  111  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.13 
 
 		 929 aa  110  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  23.91 
 
 		 929 aa  109  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  23.5 
 
 		 1304 aa  106  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  23.5 
 
 		 1304 aa  105  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1377 aa  105  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1184 aa  103  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.97 
 
 		 1184 aa  103  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1448 aa  101  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  26.7 
 
 		 1299 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  24.22 
 
 		 846 aa  100  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  23.44 
 
 		 1443 aa  100  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1435 aa  99  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1218 aa  98.6  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1360 aa  95.9  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1358 aa  95.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  26.46 
 
 		 1359 aa  94.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1346 aa  94.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  23.84 
 
 		 846 aa  94  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1361 aa  92  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1372 aa  91.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1372 aa  91.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>