171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2192 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1304 aa  2589    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  82.54 
 
 		 1299 aa  2112    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1372 aa  972    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  41.02 
 
 		 1448 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  50.19 
 
 		 1401 aa  1209    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1372 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  43.64 
 
 		 1360 aa  968    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  42.35 
 
 		 1375 aa  966    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  44.98 
 
 		 1443 aa  693    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  44.97 
 
 		 1435 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  43.25 
 
 		 1347 aa  957    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  47.92 
 
 		 1392 aa  1166    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  45.03 
 
 		 1346 aa  993    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  43.51 
 
 		 1360 aa  968    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  43.44 
 
 		 1347 aa  960    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  42.98 
 
 		 1358 aa  958    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1347 aa  958    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1372 aa  972    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1372 aa  972    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  42.6 
 
 		 1372 aa  962    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1372 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1372 aa  972    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  94.94 
 
 		 1304 aa  2436    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  29.4 
 
 		 1243 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  30.29 
 
 		 1426 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1332 aa  341  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1056 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1453 aa  239  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1434 aa  226  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  30.11 
 
 		 1359 aa  223  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1218 aa  220  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1346 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1453 aa  211  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1292 aa  205  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1361 aa  204  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1473 aa  198  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1443 aa  188  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  28.77 
 
 		 1378 aa  187  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1380 aa  187  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1232 aa  167  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1221 aa  153  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.77 
 
 		 1025 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1224 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1223 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1221 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1308 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1224 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1206 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1226 aa  140  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1224 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1262 aa  135  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  25.57 
 
 		 1382 aa  129  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1229 aa  128  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.19 
 
 		 1285 aa  125  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1352 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1273 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  27.38 
 
 		 1485 aa  123  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.62 
 
 		 1273 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1283 aa  117  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25 
 
 		 1325 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1305 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1304 aa  115  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  22.76 
 
 		 1344 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1344 aa  113  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1226 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23 
 
 		 1285 aa  111  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.06 
 
 		 1485 aa  108  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1344 aa  108  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1385 aa  105  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1341 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1377 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1451 aa  102  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1449 aa  102  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1174 aa  102  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1398 aa  101  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1299 aa  101  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  27.85 
 
 		 1441 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1402 aa  99.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1319 aa  98.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1463 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  28.33 
 
 		 1463 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1310 aa  95.1  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1258 aa  93.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1184 aa  92.8  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.56 
 
 		 1184 aa  92.8  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  28.43 
 
 		 1530 aa  92.8  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1254 aa  92  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1319 aa  91.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  20.77 
 
 		 1265 aa  90.9  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1353 aa  90.9  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1773 aa  90.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1355 aa  90.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1255 aa  87.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1174 aa  87  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1396 aa  86.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  23.55 
 
 		 1246 aa  86.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1302 aa  86.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1340 aa  85.1  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1305 aa  84.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1291 aa  84.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>