137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2200 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  100 
 
 
1396 aa  2731    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  25.53 
 
 
1392 aa  209  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  31.24 
 
 
1500 aa  189  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  32.24 
 
 
1362 aa  188  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  31.03 
 
 
1404 aa  184  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  31.65 
 
 
1398 aa  182  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  32.32 
 
 
2140 aa  177  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  31.83 
 
 
1869 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  26.29 
 
 
1448 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  29.67 
 
 
1451 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  30.97 
 
 
1428 aa  172  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  31.52 
 
 
1441 aa  172  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  31.71 
 
 
1462 aa  172  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  30.71 
 
 
1276 aa  172  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  31.03 
 
 
2032 aa  171  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  31.16 
 
 
1276 aa  165  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  30.82 
 
 
1463 aa  165  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  31.16 
 
 
1276 aa  164  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  29.77 
 
 
1406 aa  164  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  31.75 
 
 
1463 aa  161  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  28.44 
 
 
1423 aa  159  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  30.84 
 
 
1530 aa  158  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  27.39 
 
 
1405 aa  156  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  27.71 
 
 
1550 aa  152  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  26.56 
 
 
1487 aa  148  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  26.15 
 
 
1550 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.82 
 
 
1538 aa  147  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  29.25 
 
 
1084 aa  145  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  27.27 
 
 
1448 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  25.15 
 
 
1489 aa  142  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  36.23 
 
 
1937 aa  142  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  29.88 
 
 
1510 aa  141  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  27.57 
 
 
1578 aa  140  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  29.88 
 
 
1515 aa  137  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  30.02 
 
 
1501 aa  134  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  26.82 
 
 
1270 aa  132  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  31.14 
 
 
1319 aa  129  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  32.21 
 
 
1783 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.77 
 
 
1395 aa  128  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  26.68 
 
 
1335 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  28.8 
 
 
1206 aa  113  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.54 
 
 
1184 aa  96.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.54 
 
 
1184 aa  96.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  26.49 
 
 
1424 aa  94  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  26.46 
 
 
1443 aa  88.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  27.96 
 
 
1304 aa  85.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  26.22 
 
 
1401 aa  84.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  24.88 
 
 
1256 aa  84  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  27.25 
 
 
1304 aa  82.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  28.16 
 
 
1378 aa  81.6  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  26.81 
 
 
1359 aa  81.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  28.17 
 
 
1443 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  26.15 
 
 
1453 aa  79  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  34.43 
 
 
1292 aa  79  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  26.44 
 
 
1392 aa  78.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  23.58 
 
 
1232 aa  77.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  28.17 
 
 
1435 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  22.41 
 
 
1224 aa  75.1  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  28.33 
 
 
1448 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  26.08 
 
 
1299 aa  73.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  23.86 
 
 
1226 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  24.11 
 
 
1377 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  22.41 
 
 
1206 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  22.09 
 
 
1223 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  26.63 
 
 
1453 aa  70.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.45 
 
 
1352 aa  70.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.34 
 
 
1319 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  27.36 
 
 
1380 aa  68.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  23.34 
 
 
1221 aa  68.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.95 
 
 
1229 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  28.27 
 
 
1372 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  28.27 
 
 
1372 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  27.66 
 
 
1297 aa  67.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  28.27 
 
 
1372 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.34 
 
 
1221 aa  68.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  28.27 
 
 
1372 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  28.27 
 
 
1372 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  28.27 
 
 
1372 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  21.71 
 
 
1224 aa  67  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  27.35 
 
 
1375 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.83 
 
 
1346 aa  66.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  28 
 
 
1372 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  27.67 
 
 
1360 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.53 
 
 
1304 aa  64.3  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  27.67 
 
 
1358 aa  65.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  25.37 
 
 
929 aa  64.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  25.37 
 
 
929 aa  65.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  32.43 
 
 
1434 aa  63.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.76 
 
 
1353 aa  63.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  26.62 
 
 
1056 aa  62.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  29.26 
 
 
1218 aa  62.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25.45 
 
 
1243 aa  61.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  26.72 
 
 
1505 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.37 
 
 
1285 aa  60.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.6 
 
 
1485 aa  60.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  27.5 
 
 
1346 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  24.65 
 
 
1355 aa  59.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  28.94 
 
 
1174 aa  59.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  21.55 
 
 
1224 aa  58.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.93 
 
 
1305 aa  58.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>