183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2766 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  68.88 
 
 		 1451 aa  1827    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  59.27 
 
 		 1448 aa  1457    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  42.12 
 
 		 1489 aa  987    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  100 
 
 		 1463 aa  2784    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  41.77 
 
 		 1424 aa  931    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  42.54 
 
 		 1487 aa  991    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  90.7 
 
 		 1441 aa  2508    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  60.32 
 
 		 1530 aa  1544    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  98.22 
 
 		 1463 aa  2736    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  33.99 
 
 		 1423 aa  666    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1428 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1404 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1869 aa  339  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1515 aa  287  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1510 aa  285  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1538 aa  280  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1500 aa  277  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1578 aa  268  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  32.66 
 
 		 2140 aa  258  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  31.64 
 
 		 2032 aa  254  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1550 aa  219  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1276 aa  218  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1276 aa  204  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  31.83 
 
 		 1276 aa  203  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1319 aa  202  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  26.85 
 
 		 1448 aa  173  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  30.15 
 
 		 1084 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1462 aa  169  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1392 aa  167  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  24.33 
 
 		 1405 aa  166  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1206 aa  158  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1783 aa  157  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  29.1 
 
 		 1550 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1335 aa  148  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1396 aa  145  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  33.85 
 
 		 1937 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1501 aa  129  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.11 
 
 		 1184 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1184 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1224 aa  115  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1377 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1270 aa  112  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1221 aa  111  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1362 aa  110  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1224 aa  108  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1206 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1224 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1221 aa  106  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1232 aa  105  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26 
 
 		 1223 aa  104  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1229 aa  102  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1401 aa  101  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1325 aa  101  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1226 aa  98.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  29.64 
 
 		 1304 aa  94.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  29.05 
 
 		 1304 aa  92.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  29.72 
 
 		 1359 aa  91.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  29.02 
 
 		 1299 aa  91.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1352 aa  90.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1262 aa  88.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1308 aa  86.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1319 aa  85.1  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1434 aa  85.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1392 aa  84.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  23.4 
 
 		 1285 aa  84.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1273 aa  84.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24 
 
 		 1305 aa  84  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  22.61 
 
 		 1273 aa  84  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1395 aa  83.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1226 aa  82.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1256 aa  81.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.07 
 
 		 1285 aa  80.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1218 aa  80.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.26 
 
 		 1243 aa  80.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1341 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1385 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  22.85 
 
 		 1344 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1299 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1398 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1449 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1304 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1344 aa  75.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1344 aa  75.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  28.11 
 
 		 1485 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1297 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1448 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  25.35 
 
 		 1443 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1292 aa  73.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1402 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1453 aa  72.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1473 aa  72.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1453 aa  71.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1505 aa  71.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1056 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1443 aa  70.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1372 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1372 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1372 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1372 aa  70.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1310 aa  70.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>