161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0383 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  100 
 
 		 1395 aa  2697    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1487 aa  217  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  26.97 
 
 		 1448 aa  196  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  27.99 
 
 		 1463 aa  189  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  27.6 
 
 		 1550 aa  184  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1489 aa  184  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  27.55 
 
 		 1405 aa  179  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1783 aa  179  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1428 aa  178  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1448 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1869 aa  175  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1462 aa  174  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  28.46 
 
 		 1530 aa  168  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1406 aa  165  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1392 aa  164  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  26.96 
 
 		 1937 aa  161  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1404 aa  157  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1398 aa  154  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1362 aa  152  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1538 aa  144  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1510 aa  130  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1550 aa  129  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1319 aa  129  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1515 aa  126  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  26.34 
 
 		 2140 aa  125  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1276 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1270 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1578 aa  119  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  26.08 
 
 		 2032 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1396 aa  118  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1276 aa  116  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  24.37 
 
 		 1424 aa  108  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1276 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1453 aa  98.6  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  28.95 
 
 		 1084 aa  93.2  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1501 aa  92  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1308 aa  91.7  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1256 aa  89  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1206 aa  87  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  23.56 
 
 		 1285 aa  85.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  24.21 
 
 		 1705 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  31.6 
 
 		 1441 aa  84.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1451 aa  84.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1463 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1423 aa  80.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1434 aa  79.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1224 aa  78.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1335 aa  78.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1505 aa  77.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  26.69 
 
 		 1507 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  26.69 
 
 		 1507 aa  75.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1224 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1224 aa  75.1  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1297 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1500 aa  73.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  23.86 
 
 		 1273 aa  73.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1325 aa  73.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1273 aa  74.3  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1206 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1346 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1504 aa  73.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  25 
 
 		 1372 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  25 
 
 		 1372 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25 
 
 		 1372 aa  72.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25 
 
 		 1372 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25 
 
 		 1372 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25 
 
 		 1372 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25 
 
 		 1372 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1377 aa  72.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1375 aa  72  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1184 aa  72  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  22.9 
 
 		 1184 aa  72  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1360 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1358 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  26.43 
 
 		 1443 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1056 aa  68.6  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  68.6  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  22.86 
 
 		 857 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1223 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1304 aa  67  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1259 aa  67  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1443 aa  67.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  22.86 
 
 		 1259 aa  66.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  66.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1259 aa  66.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1259 aa  66.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1401 aa  66.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1259 aa  66.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.15 
 
 		 1485 aa  65.1  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1259 aa  64.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.14 
 
 		 1304 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1218 aa  64.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.06 
 
 		 1025 aa  64.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1292 aa  63.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1259 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1435 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23.87 
 
 		 1285 aa  63.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1259 aa  63.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1221 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1259 aa  62.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>