144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0464 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1550 aa  3040    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  33.73 
 
 		 1937 aa  273  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1500 aa  229  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1783 aa  204  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1395 aa  186  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1462 aa  170  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  25.47 
 
 		 1405 aa  169  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  29.73 
 
 		 1441 aa  164  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1451 aa  164  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  26.75 
 
 		 1448 aa  163  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  28.76 
 
 		 1463 aa  155  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1463 aa  154  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1392 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1423 aa  152  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1428 aa  145  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1406 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1396 aa  142  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1398 aa  139  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1448 aa  136  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  27.29 
 
 		 2140 aa  130  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  26.74 
 
 		 1530 aa  129  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  27.49 
 
 		 2032 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1404 aa  124  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1319 aa  122  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1869 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1489 aa  110  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1487 aa  107  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1550 aa  106  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1276 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1270 aa  105  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1276 aa  105  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1276 aa  105  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1362 aa  104  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1361 aa  99.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  25.73 
 
 		 1084 aa  98.6  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1453 aa  97.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1434 aa  97.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1346 aa  95.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1510 aa  92.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1377 aa  92  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1578 aa  91.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1515 aa  90.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  24.94 
 
 		 1378 aa  90.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1380 aa  88.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1473 aa  88.6  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1538 aa  87.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1375 aa  82  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1372 aa  82  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  27.53 
 
 		 1424 aa  81.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1372 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1352 aa  81.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1372 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1372 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1372 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1372 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  24.46 
 
 		 1359 aa  81.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1501 aa  80.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1206 aa  80.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1346 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  25 
 
 		 1360 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1372 aa  79.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1443 aa  79.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1347 aa  78.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1358 aa  78.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1435 aa  78.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1347 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1347 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1360 aa  77  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1453 aa  77.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1308 aa  76.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1335 aa  76.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1448 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1505 aa  75.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1504 aa  75.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  24.28 
 
 		 1304 aa  75.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  25.12 
 
 		 1443 aa  75.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1401 aa  75.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  23.8 
 
 		 1304 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  27.6 
 
 		 1507 aa  73.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  27.6 
 
 		 1507 aa  73.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1292 aa  73.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.19 
 
 		 1243 aa  72.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1262 aa  72.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  22.78 
 
 		 1285 aa  72  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1218 aa  72  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1392 aa  69.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  23.28 
 
 		 1299 aa  68.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1299 aa  67.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1290 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1325 aa  66.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1297 aa  66.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  20.84 
 
 		 1285 aa  64.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1369 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1256 aa  63.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1273 aa  63.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1385 aa  62.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  21.76 
 
 		 1273 aa  62.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1283 aa  60.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  22.39 
 
 		 1485 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1304 aa  59.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>