186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0830 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  100 
 
 		 1256 aa  2525    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1262 aa  128  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1290 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  33.2 
 
 		 1377 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  25.12 
 
 		 1405 aa  109  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1299 aa  108  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  28.1 
 
 		 1184 aa  105  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1184 aa  105  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1462 aa  100  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1319 aa  100  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1344 aa  99.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1428 aa  99.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1344 aa  99  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1325 aa  99  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1232 aa  98.6  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  23.3 
 
 		 1344 aa  98.2  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1500 aa  96.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1352 aa  97.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  25.83 
 
 		 1448 aa  97.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1341 aa  95.9  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1310 aa  95.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1221 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1297 aa  94.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1221 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1229 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1355 aa  92.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  25 
 
 		 1305 aa  92.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1226 aa  92  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1254 aa  92  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1304 aa  90.9  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  23.06 
 
 		 1249 aa  91.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1449 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1398 aa  89  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1353 aa  88.6  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1224 aa  88.6  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  26.15 
 
 		 1530 aa  88.6  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  22.29 
 
 		 1025 aa  88.2  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1402 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1223 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  24.6 
 
 		 1441 aa  85.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1423 aa  85.5  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1395 aa  85.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  26.64 
 
 		 1485 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1224 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1290 aa  84.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1385 aa  84  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1448 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  28.63 
 
 		 1485 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1224 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1226 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1404 aa  83.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  25.4 
 
 		 1382 aa  82.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  24.53 
 
 		 1342 aa  82  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1206 aa  82  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  21.73 
 
 		 846 aa  81.6  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1308 aa  80.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  20.82 
 
 		 846 aa  79.7  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  25.68 
 
 		 1937 aa  79.7  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1783 aa  79.7  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1406 aa  79.3  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1451 aa  78.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  30 
 
 		 1463 aa  78.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  30 
 
 		 1463 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  22.71 
 
 		 1285 aa  77.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1489 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1396 aa  76.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1369 aa  76.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  24.94 
 
 		 1443 aa  75.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1358 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1360 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  20.74 
 
 		 1254 aa  74.7  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1319 aa  74.7  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1401 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1270 aa  74.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1487 aa  74.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1283 aa  74.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1256 aa  74.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1292 aa  73.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1435 aa  73.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1375 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  25.93 
 
 		 1550 aa  72.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  28.89 
 
 		 1299 aa  72.4  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1346 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1340 aa  72.4  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1664 aa  72  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1265 aa  71.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1664 aa  70.1  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1448 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1346 aa  70.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1434 aa  70.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1392 aa  69.3  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  27.23 
 
 		 1304 aa  69.3  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  24.49 
 
 		 1359 aa  69.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1869 aa  68.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1372 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  26.81 
 
 		 1304 aa  68.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  21.23 
 
 		 1550 aa  68.9  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1372 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1372 aa  68.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1372 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>