159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4089 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  100 
 
 		 1404 aa  2747    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  37.73 
 
 		 2032 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  38.61 
 
 		 2140 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  45.51 
 
 		 1869 aa  798    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1448 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  28.36 
 
 		 1530 aa  429  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  28.66 
 
 		 1441 aa  426  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  28.52 
 
 		 1463 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1463 aa  412  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1423 aa  355  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  26.07 
 
 		 1424 aa  352  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1489 aa  347  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1428 aa  343  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1487 aa  330  9e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  38.62 
 
 		 1538 aa  320  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  34.11 
 
 		 1550 aa  313  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1515 aa  297  8e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1510 aa  296  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1578 aa  283  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1276 aa  260  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1276 aa  259  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1276 aa  242  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  37.8 
 
 		 1084 aa  238  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  24.13 
 
 		 1405 aa  221  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  40.71 
 
 		 1206 aa  217  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1319 aa  194  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1500 aa  193  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1501 aa  193  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  25.75 
 
 		 1448 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1396 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1462 aa  160  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1335 aa  159  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1395 aa  148  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1406 aa  144  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1362 aa  140  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1392 aa  138  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1270 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1783 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  31.05 
 
 		 1937 aa  133  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.98 
 
 		 1550 aa  125  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1398 aa  120  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  26.88 
 
 		 1507 aa  111  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  26.7 
 
 		 1507 aa  109  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1504 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  23.06 
 
 		 1243 aa  99.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1451 aa  97.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1223 aa  95.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1206 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1361 aa  92  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1256 aa  90.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1224 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1224 aa  89.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  21.76 
 
 		 1285 aa  87.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1377 aa  84  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1346 aa  84  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1056 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1229 aa  82.4  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25 
 
 		 1025 aa  82.4  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1325 aa  82.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1505 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1232 aa  78.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1473 aa  78.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1273 aa  77.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1255 aa  76.3  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  22.53 
 
 		 1273 aa  75.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1290 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  24.81 
 
 		 1359 aa  74.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1453 aa  73.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1319 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  23.85 
 
 		 1246 aa  72  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1443 aa  72  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1224 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1434 aa  71.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1308 aa  70.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1292 aa  70.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1226 aa  69.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  22.1 
 
 		 1285 aa  69.3  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  22.76 
 
 		 1344 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1184 aa  69.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  22.77 
 
 		 1184 aa  69.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1341 aa  67  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1310 aa  66.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  22.65 
 
 		 1378 aa  66.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1344 aa  66.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1218 aa  65.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  25 
 
 		 1392 aa  65.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1310 aa  65.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1221 aa  65.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1344 aa  65.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1304 aa  65.1  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1453 aa  65.1  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1221 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.45 
 
 		 1485 aa  64.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1283 aa  63.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4866  protein of unknown function DUF490  23.11 
 
 		 1601 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  23 
 
 		 1353 aa  63.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  22 
 
 		 1485 aa  62  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1319 aa  62  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1352 aa  61.6  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1380 aa  61.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>