177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0432 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1448 aa  2873    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  26.92 
 
 
1451 aa  214  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  28.84 
 
 
1500 aa  214  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  28.52 
 
 
1405 aa  213  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  27.6 
 
 
1441 aa  202  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  26.8 
 
 
1395 aa  202  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.29 
 
 
1462 aa  201  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  26.32 
 
 
1869 aa  195  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  26.85 
 
 
1463 aa  194  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  27.19 
 
 
1463 aa  190  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  27.65 
 
 
1530 aa  188  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  27.71 
 
 
1489 aa  185  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  26.42 
 
 
1404 aa  184  9.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  25.84 
 
 
1396 aa  178  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  26.84 
 
 
1448 aa  174  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  25.77 
 
 
1487 aa  174  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  24.25 
 
 
1423 aa  172  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.87 
 
 
1550 aa  172  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  25.06 
 
 
1428 aa  171  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  27.22 
 
 
2140 aa  164  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  27.25 
 
 
2032 aa  163  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  28.32 
 
 
1276 aa  155  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  29.95 
 
 
1276 aa  155  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  29.95 
 
 
1276 aa  155  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  25.62 
 
 
1937 aa  155  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  30.92 
 
 
1783 aa  154  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  28.96 
 
 
1270 aa  152  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  31.58 
 
 
1084 aa  149  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  26.65 
 
 
1362 aa  143  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  25.57 
 
 
1392 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  24.27 
 
 
1550 aa  142  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  25.99 
 
 
1206 aa  134  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  30.99 
 
 
1406 aa  133  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  27.07 
 
 
1319 aa  129  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  26.02 
 
 
1538 aa  128  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.64 
 
 
1377 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  25.87 
 
 
1501 aa  116  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  24.38 
 
 
1578 aa  115  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  27.08 
 
 
1515 aa  115  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  26.79 
 
 
1510 aa  113  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  24.82 
 
 
1424 aa  107  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  25.08 
 
 
1398 aa  105  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  25.63 
 
 
1434 aa  105  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  26.8 
 
 
1256 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  26.74 
 
 
1352 aa  100  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.81 
 
 
1325 aa  97.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  26.56 
 
 
1335 aa  95.1  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  22.68 
 
 
1453 aa  92.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  24.5 
 
 
1372 aa  92.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.34 
 
 
1443 aa  92.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.39 
 
 
1346 aa  92  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  24.96 
 
 
1285 aa  91.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  24.3 
 
 
1372 aa  91.7  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  24.3 
 
 
1372 aa  91.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  24.3 
 
 
1372 aa  91.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  24.3 
 
 
1372 aa  91.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  24.3 
 
 
1372 aa  91.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.52 
 
 
1308 aa  90.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  24.51 
 
 
1375 aa  89.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  24.13 
 
 
1372 aa  89.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.98 
 
 
1361 aa  89  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  23.97 
 
 
1243 aa  88.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  25.11 
 
 
1435 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  24.25 
 
 
1358 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  24.25 
 
 
1360 aa  87.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  27.75 
 
 
1359 aa  86.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  25.37 
 
 
1443 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  23.04 
 
 
1285 aa  85.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  27.93 
 
 
1292 aa  85.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  24.95 
 
 
1378 aa  85.1  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  24.35 
 
 
1249 aa  85.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  24.94 
 
 
1448 aa  83.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.29 
 
 
1224 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  24.45 
 
 
1380 aa  82.4  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  24.63 
 
 
1347 aa  82.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  24.63 
 
 
1347 aa  82.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  23.37 
 
 
1273 aa  82.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  23.37 
 
 
1273 aa  82  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  25.27 
 
 
1504 aa  81.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.14 
 
 
1206 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  24.44 
 
 
1347 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  23.94 
 
 
1346 aa  80.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  27.06 
 
 
1473 aa  79.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  24.26 
 
 
1224 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  24.68 
 
 
1507 aa  78.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.46 
 
 
1226 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24 
 
 
1223 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  22.93 
 
 
1254 aa  77.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  24.08 
 
 
1290 aa  77.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  24.58 
 
 
1360 aa  75.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  22.72 
 
 
1254 aa  75.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  24.68 
 
 
1507 aa  75.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24 
 
 
1262 aa  73.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  26.1 
 
 
1224 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.54 
 
 
1221 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  22.3 
 
 
1299 aa  73.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  26.44 
 
 
1229 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  22.17 
 
 
1401 aa  72.4  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.95 
 
 
1221 aa  72.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.02 
 
 
1319 aa  71.6  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>