91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0184 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  97.72 
 
 
1507 aa  2630    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  52.25 
 
 
1505 aa  1302    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1507 aa  2812    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  91.71 
 
 
1504 aa  2371    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  26.77 
 
 
1515 aa  125  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  26.23 
 
 
1462 aa  99.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  26 
 
 
1404 aa  92.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.26 
 
 
1485 aa  85.5  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  24.25 
 
 
1485 aa  85.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  31.07 
 
 
1500 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  26.36 
 
 
1325 aa  83.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  27.53 
 
 
1401 aa  79.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  24.07 
 
 
1304 aa  73.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.93 
 
 
1352 aa  72.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  24.22 
 
 
1448 aa  72.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  26.41 
 
 
1392 aa  72.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.31 
 
 
1304 aa  72.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  29.11 
 
 
1395 aa  71.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  28.5 
 
 
1299 aa  71.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  27.54 
 
 
1441 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  27.8 
 
 
1550 aa  70.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  24.2 
 
 
1405 aa  69.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  30.95 
 
 
1392 aa  68.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  25.8 
 
 
1428 aa  67  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  29.35 
 
 
1530 aa  65.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  29.17 
 
 
1434 aa  65.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  26.09 
 
 
1937 aa  65.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  25 
 
 
2032 aa  64.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  20.65 
 
 
1550 aa  62.4  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  23.08 
 
 
1869 aa  62  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  25.79 
 
 
1451 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  26.54 
 
 
1463 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  24.36 
 
 
2140 aa  61.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  22.09 
 
 
1377 aa  59.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  28.9 
 
 
1453 aa  59.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.1 
 
 
1308 aa  57.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  26.29 
 
 
1463 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  25.52 
 
 
1347 aa  57  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  24.96 
 
 
1705 aa  56.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  25.33 
 
 
1347 aa  55.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  25.65 
 
 
1783 aa  55.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  25.33 
 
 
1347 aa  55.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  22.78 
 
 
1362 aa  55.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  24.45 
 
 
1372 aa  55.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  24.45 
 
 
1372 aa  55.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  22.4 
 
 
1262 aa  55.5  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  24.45 
 
 
1372 aa  55.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  24.45 
 
 
1372 aa  55.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  23.08 
 
 
1396 aa  54.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  24.45 
 
 
1372 aa  55.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  24.45 
 
 
1372 aa  55.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  24.45 
 
 
1372 aa  55.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.42 
 
 
1346 aa  54.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  24.15 
 
 
1423 aa  53.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  29.61 
 
 
1243 aa  54.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  24.63 
 
 
1375 aa  54.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  25.59 
 
 
1292 aa  54.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  26.46 
 
 
1406 aa  54.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  24.95 
 
 
1512 aa  53.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  24.83 
 
 
1084 aa  53.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  25.66 
 
 
1270 aa  53.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  26.24 
 
 
1448 aa  53.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  24.06 
 
 
1360 aa  53.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  24.06 
 
 
1358 aa  52.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  26.17 
 
 
1424 aa  52.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  25.75 
 
 
1382 aa  52  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  22.98 
 
 
1255 aa  51.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  23.08 
 
 
1359 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  23.02 
 
 
1256 aa  50.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  24.54 
 
 
1443 aa  49.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  24.77 
 
 
1319 aa  49.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  21.54 
 
 
1276 aa  49.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  29.23 
 
 
1206 aa  48.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.18 
 
 
1221 aa  48.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.48 
 
 
1232 aa  48.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25 
 
 
1226 aa  48.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.08 
 
 
1221 aa  48.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  26.78 
 
 
1283 aa  48.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  25.23 
 
 
1398 aa  47.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  23.11 
 
 
1487 aa  47  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2878  hypothetical protein  22.94 
 
 
1829 aa  47  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.41175 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  21.86 
 
 
1276 aa  46.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  21.86 
 
 
1276 aa  46.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  21.4 
 
 
1435 aa  45.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  21.64 
 
 
1224 aa  45.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  23.31 
 
 
1025 aa  45.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.7 
 
 
1448 aa  45.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.31 
 
 
1229 aa  45.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.16 
 
 
1443 aa  45.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  24.88 
 
 
1773 aa  45.1  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25.58 
 
 
1226 aa  45.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>