127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2617 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  38.83 
 
 		 1489 aa  932    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  42.68 
 
 		 1530 aa  973    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  39.48 
 
 		 1487 aa  946    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  41.77 
 
 		 1463 aa  979    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1424 aa  2729    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  41.77 
 
 		 1463 aa  978    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  44.02 
 
 		 1451 aa  1030    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  43.02 
 
 		 1448 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  42.37 
 
 		 1441 aa  999    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1423 aa  582  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1428 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1404 aa  364  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1869 aa  297  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1515 aa  271  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1510 aa  269  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1500 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1578 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1538 aa  258  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  34.12 
 
 		 2140 aa  254  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  32.12 
 
 		 2032 aa  247  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1550 aa  191  8e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  35.1 
 
 		 1276 aa  186  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1276 aa  178  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1206 aa  176  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1276 aa  176  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1319 aa  171  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1462 aa  158  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1501 aa  158  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1335 aa  149  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  30.51 
 
 		 1084 aa  147  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1392 aa  125  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1398 aa  122  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1406 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  24.75 
 
 		 1448 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1395 aa  112  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  24.17 
 
 		 1405 aa  106  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1270 aa  102  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  37.56 
 
 		 1937 aa  100  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  25.99 
 
 		 1550 aa  96.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1396 aa  92.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1184 aa  92  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  26.58 
 
 		 1184 aa  92  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1783 aa  89.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1310 aa  86.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1377 aa  85.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1262 aa  81.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1308 aa  81.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1226 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1229 aa  72.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1224 aa  72  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1325 aa  70.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1319 aa  66.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1224 aa  65.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1362 aa  65.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1352 aa  65.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1232 aa  63.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1256 aa  62  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1223 aa  62  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0687  protein of unknown function DUF490  27.37 
 
 		 1308 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0688  protein of unknown function DUF490  27.37 
 
 		 1308 aa  59.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1206 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.6 
 
 		 1485 aa  59.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  23.67 
 
 		 1705 aa  59.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1224 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1292 aa  58.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1226 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  24.6 
 
 		 1485 aa  57.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0653  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1308 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0907804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1361 aa  57.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1305 aa  57.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1255 aa  57  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1304 aa  56.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1221 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1398 aa  55.5  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1290 aa  55.5  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1346 aa  55.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  26.86 
 
 		 1246 aa  55.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  26.02 
 
 		 1378 aa  54.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  25.99 
 
 		 1507 aa  55.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1401 aa  54.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  24.41 
 
 		 1382 aa  54.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1402 aa  54.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1385 aa  53.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25.65 
 
 		 1243 aa  53.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1218 aa  52.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.63 
 
 		 1025 aa  52.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1299 aa  52.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1434 aa  52.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1449 aa  52  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1353 aa  52  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0240  hypothetical protein  24.42 
 
 		 2049 aa  51.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.930824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1369 aa  51.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1221 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1664 aa  50.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1504 aa  51.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1056 aa  50.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1664 aa  50.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1297 aa  50.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1346 aa  50.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1448 aa  50.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>