41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0240 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0240  hypothetical protein  100 
 
 
2049 aa  4029    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.930824  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4575  hypothetical protein  52.58 
 
 
1831 aa  1518    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.427026  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4258  protein of unknown function DUF490  34.84 
 
 
1846 aa  764    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.013451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4866  protein of unknown function DUF490  37.74 
 
 
1601 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2994  protein of unknown function DUF490  35.87 
 
 
1813 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4219  protein of unknown function DUF490  34.77 
 
 
1846 aa  764    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2878  hypothetical protein  37.48 
 
 
1829 aa  839    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.41175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0342  hypothetical protein  29.49 
 
 
2322 aa  636  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1788  hypothetical protein  29.6 
 
 
1568 aa  409  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.420849  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4502  protein of unknown function DUF490  25.62 
 
 
1981 aa  311  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4440  protein of unknown function DUF490  25.29 
 
 
1981 aa  307  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5316  protein of unknown function DUF490  27.5 
 
 
1982 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2674  protein of unknown function DUF490  26.13 
 
 
1975 aa  259  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3430  protein of unknown function DUF490  25.56 
 
 
1975 aa  244  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0447  protein of unknown function DUF490  27.01 
 
 
1887 aa  221  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10621  hypothetical protein  23.95 
 
 
1326 aa  147  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.860868  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0025  hypothetical protein  24.8 
 
 
1319 aa  144  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0925  hypothetical protein  24.38 
 
 
1475 aa  142  7e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40935  predicted protein  20.5 
 
 
926 aa  141  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240067 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06451  hypothetical protein  24.49 
 
 
1319 aa  141  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18431  hypothetical protein  23.16 
 
 
1478 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1024  hypothetical protein  24.67 
 
 
1473 aa  117  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.939062  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06451  hypothetical protein  22.85 
 
 
1298 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06541  hypothetical protein  24.27 
 
 
1315 aa  100  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06151  hypothetical protein  22.96 
 
 
1296 aa  97.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0589  hypothetical protein  20.85 
 
 
1360 aa  73.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  24.71 
 
 
1369 aa  60.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  23.53 
 
 
1310 aa  56.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  22.66 
 
 
1404 aa  55.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  22.08 
 
 
1448 aa  53.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  22.95 
 
 
1441 aa  52.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  23.06 
 
 
1487 aa  51.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  22.22 
 
 
1466 aa  50.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  21.82 
 
 
1423 aa  50.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  21.75 
 
 
1405 aa  49.3  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  23.46 
 
 
1428 aa  49.3  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  21.43 
 
 
1530 aa  48.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  21.26 
 
 
1869 aa  47.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  21.36 
 
 
1308 aa  47  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  23.86 
 
 
1463 aa  46.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  22.09 
 
 
1451 aa  45.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>