28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0025 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0025  hypothetical protein  100 
 
 
1319 aa  2609    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10621  hypothetical protein  37.31 
 
 
1326 aa  884    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.860868  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06451  hypothetical protein  99.01 
 
 
1319 aa  2583    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18431  hypothetical protein  38.39 
 
 
1478 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0925  hypothetical protein  31.33 
 
 
1475 aa  533  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1024  hypothetical protein  29.43 
 
 
1473 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.939062  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06451  hypothetical protein  28.13 
 
 
1298 aa  452  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06151  hypothetical protein  28.34 
 
 
1296 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06541  hypothetical protein  27.66 
 
 
1315 aa  439  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0589  hypothetical protein  26.8 
 
 
1360 aa  416  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1788  hypothetical protein  25.37 
 
 
1568 aa  162  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.420849  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2878  hypothetical protein  22.73 
 
 
1829 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.41175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0240  hypothetical protein  24.17 
 
 
2049 aa  154  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.930824  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2994  protein of unknown function DUF490  23.61 
 
 
1813 aa  145  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4575  hypothetical protein  21.94 
 
 
1831 aa  137  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.427026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4866  protein of unknown function DUF490  22.09 
 
 
1601 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40935  predicted protein  26.96 
 
 
926 aa  116  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0342  hypothetical protein  24.11 
 
 
2322 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4219  protein of unknown function DUF490  26.44 
 
 
1846 aa  85.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4258  protein of unknown function DUF490  26.44 
 
 
1846 aa  85.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.013451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5316  protein of unknown function DUF490  22.97 
 
 
1982 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4502  protein of unknown function DUF490  20.94 
 
 
1981 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4440  protein of unknown function DUF490  20.91 
 
 
1981 aa  70.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0447  protein of unknown function DUF490  21.47 
 
 
1887 aa  63.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2674  protein of unknown function DUF490  22.05 
 
 
1975 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3430  protein of unknown function DUF490  22.76 
 
 
1975 aa  57.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  26.04 
 
 
2140 aa  50.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  24.87 
 
 
2032 aa  45.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>