34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3560 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1466 aa  2914    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  28.54 
 
 
1594 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  27.38 
 
 
1494 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  25.59 
 
 
1532 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  24.74 
 
 
1564 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  24.18 
 
 
1491 aa  362  4e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  24.55 
 
 
1712 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  26.2 
 
 
1446 aa  354  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  25.09 
 
 
1650 aa  341  5e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  23.34 
 
 
1513 aa  334  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  21.31 
 
 
1493 aa  290  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  23.35 
 
 
1699 aa  287  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  22.88 
 
 
1644 aa  264  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  22.47 
 
 
1690 aa  234  8.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  22.45 
 
 
1691 aa  232  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  20.56 
 
 
1515 aa  196  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  23.33 
 
 
1686 aa  140  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  21.48 
 
 
1512 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  18.1 
 
 
1540 aa  93.6  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  21.93 
 
 
1596 aa  86.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  19.67 
 
 
1494 aa  73.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  20.4 
 
 
1502 aa  71.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  21.14 
 
 
1705 aa  68.6  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  20.46 
 
 
1521 aa  62  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  22.93 
 
 
1448 aa  55.5  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2878  hypothetical protein  24.17 
 
 
1829 aa  55.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.41175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4575  hypothetical protein  24.29 
 
 
1831 aa  54.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.427026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  19.87 
 
 
1511 aa  55.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  20 
 
 
1535 aa  52.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0240  hypothetical protein  22.22 
 
 
2049 aa  50.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.930824  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  19.09 
 
 
1504 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  19.09 
 
 
1507 aa  45.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  19.64 
 
 
1505 aa  45.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1788  hypothetical protein  21.03 
 
 
1568 aa  45.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.420849  normal  0.0437716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>