23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1224 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  100 
 
 		 1650 aa  3343    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1699 aa  758    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  27.79 
 
 		 1690 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  29.57 
 
 		 1712 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  27.14 
 
 		 1644 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1686 aa  632  1e-179  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  25.09 
 
 		 1691 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  22.94 
 
 		 1594 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  24.98 
 
 		 1466 aa  344  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1532 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1491 aa  275  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1493 aa  231  9e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1513 aa  228  9e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1446 aa  210  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  23.85 
 
 		 1564 aa  195  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1494 aa  164  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1596 aa  143  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  22.19 
 
 		 1512 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1515 aa  106  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1502 aa  62.4  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1352 aa  50.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1259 aa  48.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1511 aa  45.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>