19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1460 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1491 aa  1040    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 1446 aa  2935    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1494 aa  966    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  26.18 
 
 		 1466 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  23.24 
 
 		 1564 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1532 aa  292  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1513 aa  270  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  22.5 
 
 		 1594 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1493 aa  247  9.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  22.48 
 
 		 1644 aa  224  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  22.93 
 
 		 1712 aa  217  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1699 aa  217  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1515 aa  211  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1650 aa  211  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1686 aa  204  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  23.73 
 
 		 1691 aa  123  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  20.93 
 
 		 1690 aa  110  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1596 aa  104  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  25.92 
 
 		 1512 aa  99  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>