26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5933 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1594 aa  3237    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  28.54 
 
 		 1466 aa  460  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1650 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1532 aa  387  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1699 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  22.37 
 
 		 1644 aa  354  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1513 aa  346  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  23.13 
 
 		 1712 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1491 aa  332  5.0000000000000004e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1493 aa  330  1.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1686 aa  327  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1494 aa  307  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  22.32 
 
 		 1690 aa  294  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1446 aa  263  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  26.86 
 
 		 1564 aa  250  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  22.07 
 
 		 1691 aa  232  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  20.56 
 
 		 1515 aa  178  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1596 aa  125  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  22.5 
 
 		 1512 aa  112  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  20.71 
 
 		 1512 aa  60.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  20.38 
 
 		 1494 aa  60.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  19.15 
 
 		 1540 aa  55.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  19.93 
 
 		 1705 aa  52.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  20.69 
 
 		 1502 aa  50.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1511 aa  46.2  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1535 aa  45.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.427832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>