23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3011 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  43.94 
 
 		 1564 aa  1244    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1513 aa  688    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  100 
 
 		 1532 aa  3122    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1493 aa  535  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  25.59 
 
 		 1466 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  24.53 
 
 		 1594 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  23.1 
 
 		 1712 aa  324  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  22.83 
 
 		 1644 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1491 aa  296  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1446 aa  295  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1699 aa  285  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1494 aa  285  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1650 aa  279  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  22.13 
 
 		 1690 aa  230  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1686 aa  230  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1515 aa  219  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  22.02 
 
 		 1691 aa  199  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  23.82 
 
 		 1512 aa  155  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1596 aa  116  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  18.93 
 
 		 1535 aa  67  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  20.09 
 
 		 1540 aa  61.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  18.79 
 
 		 1512 aa  59.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1511 aa  53.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>