26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3471 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  27.62 
 
 
1691 aa  712    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  29.4 
 
 
1650 aa  783    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  28.6 
 
 
1690 aa  713    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  35.38 
 
 
1699 aa  1054    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1712 aa  3452    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  30.11 
 
 
1644 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  27.25 
 
 
1686 aa  626  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  24.4 
 
 
1466 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  23.03 
 
 
1594 aa  343  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  23.03 
 
 
1532 aa  317  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  23.8 
 
 
1494 aa  280  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  22.21 
 
 
1491 aa  252  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  22.38 
 
 
1493 aa  237  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  21.24 
 
 
1513 aa  225  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  22.93 
 
 
1446 aa  217  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  23.34 
 
 
1564 aa  185  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  20.44 
 
 
1596 aa  178  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  20.02 
 
 
1515 aa  118  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  21.29 
 
 
1512 aa  108  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  19.89 
 
 
1502 aa  76.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  21.07 
 
 
1511 aa  66.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  21.31 
 
 
1535 aa  59.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  23.99 
 
 
1521 aa  58.9  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  25.76 
 
 
1515 aa  51.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  30.86 
 
 
809 aa  46.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  26.55 
 
 
1319 aa  46.2  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>