23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4592 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  42.7 
 
 
1491 aa  1217    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  37.78 
 
 
1446 aa  986    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  100 
 
 
1494 aa  2983    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  27.36 
 
 
1466 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  23.24 
 
 
1594 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  23.81 
 
 
1513 aa  305  6.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  23.87 
 
 
1712 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  22.63 
 
 
1532 aa  279  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  22.07 
 
 
1564 aa  278  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  22.66 
 
 
1493 aa  257  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  20.7 
 
 
1515 aa  239  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  22.76 
 
 
1699 aa  234  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  21.46 
 
 
1690 aa  207  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  20.55 
 
 
1686 aa  175  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  24.24 
 
 
1650 aa  171  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  23.99 
 
 
1691 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  23.58 
 
 
1644 aa  124  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  21.73 
 
 
1512 aa  123  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  23.57 
 
 
1596 aa  112  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  20.3 
 
 
1705 aa  58.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  22.49 
 
 
1494 aa  54.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  22.03 
 
 
1502 aa  48.5  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  20.8 
 
 
1540 aa  45.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>