16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1615 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  39.7 
 
 
1535 aa  1123    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  100 
 
 
1540 aa  3157    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  40.16 
 
 
1512 aa  1181    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  41.95 
 
 
1521 aa  1243    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  35.13 
 
 
1494 aa  934    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  34.39 
 
 
1502 aa  914    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  44.94 
 
 
1511 aa  1343    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  21.45 
 
 
1513 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  18.1 
 
 
1466 aa  92  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  19.18 
 
 
1512 aa  69.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  19.18 
 
 
1493 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  21.83 
 
 
1564 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  20.64 
 
 
1532 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  18.18 
 
 
1594 aa  49.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  20.17 
 
 
1644 aa  48.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  22.31 
 
 
1494 aa  45.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>