30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3080 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1564 aa  3180    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  43.74 
 
 		 1532 aa  1254    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1513 aa  635  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1493 aa  548  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  24.74 
 
 		 1466 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1446 aa  307  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1491 aa  292  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  23.51 
 
 		 1644 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1494 aa  276  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1699 aa  273  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  26.86 
 
 		 1594 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  21.62 
 
 		 1690 aa  219  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1686 aa  218  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1515 aa  209  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1650 aa  200  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  23.9 
 
 		 1712 aa  190  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  25.8 
 
 		 1691 aa  171  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  22.46 
 
 		 1512 aa  160  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  19.6 
 
 		 1596 aa  92  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  20.08 
 
 		 1494 aa  77.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1540 aa  63.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  20.63 
 
 		 1511 aa  56.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1512 aa  56.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  29.8 
 
 		 978 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1002 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  29.17 
 
 		 978 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  28.65 
 
 		 978 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1515 aa  48.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1521 aa  47.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1510 aa  47.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>