114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4704 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  100 
 
 		 978 aa  1967    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  72.77 
 
 		 1002 aa  1474    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  73.34 
 
 		 1009 aa  1482    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  75.81 
 
 		 983 aa  1496    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  62.57 
 
 		 1088 aa  858    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  59.82 
 
 		 981 aa  1177    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  64.83 
 
 		 960 aa  1300    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  99.08 
 
 		 978 aa  1951    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  65.88 
 
 		 1088 aa  856    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  96.22 
 
 		 978 aa  1899    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  89.16 
 
 		 978 aa  1728    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  29.6 
 
 		 996 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1013 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1072 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1024 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  29.4 
 
 		 1067 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1069 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1011 aa  389  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1073 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  28.04 
 
 		 954 aa  383  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  28.91 
 
 		 1032 aa  385  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2578  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1076 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.380474  normal  0.372826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1119 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1087 aa  369  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3419  hypothetical protein  28.91 
 
 		 982 aa  360  8e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0573665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1074 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1061 aa  350  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3110  hypothetical protein  35.3 
 
 		 1021 aa  348  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  28.6 
 
 		 1216 aa  347  8.999999999999999e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2679  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1065 aa  345  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  32.9 
 
 		 1154 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  33.38 
 
 		 1158 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1161 aa  334  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  28.88 
 
 		 950 aa  334  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  33.33 
 
 		 1151 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  28.34 
 
 		 1260 aa  330  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  28.03 
 
 		 1266 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1181 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1893  protein of unknown function DUF748  28.36 
 
 		 1266 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  28.61 
 
 		 1208 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  28.94 
 
 		 1210 aa  321  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  25.6 
 
 		 1247 aa  318  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1187 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1040 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  28.21 
 
 		 1261 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1128 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1304 aa  301  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1041 aa  301  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1098 aa  300  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1156 aa  300  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1189 aa  300  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1337 aa  299  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1287  protein of unknown function DUF748  24.94 
 
 		 1080 aa  294  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.701723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1283 aa  293  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3490  hypothetical protein  25.68 
 
 		 953 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1268 aa  292  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1169 aa  291  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1277 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1200 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3574  protein of unknown function DUF748  26.72 
 
 		 957 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217437  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1268 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1271 aa  283  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1135 aa  281  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3642  protein of unknown function DUF748  26.49 
 
 		 955 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1382 aa  278  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1275 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1275 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1264 aa  276  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0857  hypothetical protein  26.43 
 
 		 968 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.239267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1264 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1169 aa  270  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2234  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1260 aa  267  7e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1281 aa  265  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1124 aa  264  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  29.16 
 
 		 1144 aa  258  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0632  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1197 aa  250  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2904  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1298 aa  247  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.651688  normal  0.0396842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1016 aa  247  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1261 aa  240  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  26.94 
 
 		 1112 aa  237  7e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  27.22 
 
 		 1330 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2029  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1161 aa  226  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  24.66 
 
 		 1235 aa  224  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0861  transcription termination factor  30.07 
 
 		 1081 aa  218  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1307 aa  217  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1348 aa  217  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1307 aa  217  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1307 aa  217  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1318 aa  217  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1307 aa  217  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  38.06 
 
 		 1321 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1235 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2872  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1364 aa  215  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.325754  normal  0.590443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1295 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  32.3 
 
 		 1275 aa  197  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  24.01 
 
 		 1428 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0312  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1022 aa  174  7.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.949397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1354 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  28 
 
 		 1025 aa  169  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1111  hypothetical protein  25.19 
 
 		 806 aa  167  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.685916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>