28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3195 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1644 aa  3319    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1650 aa  661    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  37.39 
 
 		 1691 aa  1136    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1699 aa  915    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  28.67 
 
 		 1690 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  30.58 
 
 		 1712 aa  823    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1686 aa  559  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  22.42 
 
 		 1594 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1532 aa  294  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  23.58 
 
 		 1564 aa  278  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  22.83 
 
 		 1466 aa  268  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1491 aa  254  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1446 aa  231  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  21.49 
 
 		 1493 aa  230  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1513 aa  218  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1494 aa  214  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  20.66 
 
 		 1515 aa  177  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  21.23 
 
 		 1596 aa  170  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  24.22 
 
 		 1512 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1502 aa  93.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  20.57 
 
 		 1535 aa  72  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  19.58 
 
 		 1511 aa  63.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  19.86 
 
 		 1512 aa  62.4  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  19.08 
 
 		 1521 aa  58.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1505 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1494 aa  49.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1540 aa  48.9  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1087 aa  47.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>