17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1902 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  39.81 
 
 
1540 aa  1126    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  46.9 
 
 
1511 aa  1407    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  35.56 
 
 
1502 aa  988    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  39.7 
 
 
1494 aa  1108    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  46.89 
 
 
1521 aa  1404    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  43.86 
 
 
1512 aa  1294    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  100 
 
 
1535 aa  3091    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  19.12 
 
 
1532 aa  64.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  21.31 
 
 
1712 aa  59.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  20.25 
 
 
1466 aa  56.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  20.65 
 
 
1564 aa  55.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  21.52 
 
 
1699 aa  53.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  18.99 
 
 
1594 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  21.55 
 
 
1512 aa  51.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  19.39 
 
 
1513 aa  50.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  25.28 
 
 
1319 aa  47.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  24.29 
 
 
1691 aa  47.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>