15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0267 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1535 aa  1365    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1540 aa  1216    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  52.49 
 
 		 1512 aa  1654    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  100 
 
 		 1521 aa  3094    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1494 aa  1191    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1502 aa  1090    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  50.33 
 
 		 1511 aa  1519    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  19.91 
 
 		 1493 aa  90.1  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  20.68 
 
 		 1512 aa  89.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  20.46 
 
 		 1466 aa  62  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  23.99 
 
 		 1712 aa  58.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1513 aa  56.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  18.99 
 
 		 1644 aa  56.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1256 aa  48.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  21.06 
 
 		 1564 aa  47  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>