19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2603 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  44.74 
 
 		 1540 aa  1325    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 1511 aa  3067    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  37.48 
 
 		 1502 aa  1047    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  39.84 
 
 		 1494 aa  1133    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  50.33 
 
 		 1521 aa  1536    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  47.42 
 
 		 1512 aa  1473    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  46.71 
 
 		 1535 aa  1390    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1513 aa  74.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  20.84 
 
 		 1493 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  21.07 
 
 		 1712 aa  65.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  19.38 
 
 		 1644 aa  61.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1699 aa  59.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  21.67 
 
 		 1512 aa  58.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  20.63 
 
 		 1564 aa  56.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  21.26 
 
 		 1466 aa  54.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  21.05 
 
 		 1691 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  26.03 
 
 		 1594 aa  45.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1650 aa  45.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  22.43 
 
 		 1705 aa  45.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>