19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0367 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1615  hypothetical protein  35.37 
 
 
1540 aa  919    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  39.84 
 
 
1511 aa  1129    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  50.27 
 
 
1502 aa  1502    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  100 
 
 
1494 aa  3023    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0267  hypothetical protein  41.94 
 
 
1521 aa  1194    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  39.74 
 
 
1512 aa  1127    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  39.5 
 
 
1535 aa  1077    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  19.58 
 
 
1493 aa  82.8  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  20.58 
 
 
1564 aa  75.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  19.53 
 
 
1466 aa  72.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  20.61 
 
 
1513 aa  62.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  20.18 
 
 
1594 aa  60.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  21.93 
 
 
1256 aa  57  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  22.49 
 
 
1494 aa  54.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  20.11 
 
 
1705 aa  54.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  23.61 
 
 
1515 aa  50.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  18.49 
 
 
1644 aa  49.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  20.81 
 
 
1512 aa  48.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  20.21 
 
 
1491 aa  47  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>