21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13133 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  100 
 
 
1491 aa  2977    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  42.63 
 
 
1494 aa  1198    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  38.47 
 
 
1446 aa  1043    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  24.25 
 
 
1466 aa  356  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  23.76 
 
 
1594 aa  326  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  24.16 
 
 
1513 aa  319  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  23.43 
 
 
1493 aa  302  3e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  23.45 
 
 
1532 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  22.25 
 
 
1564 aa  293  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  23.91 
 
 
1650 aa  271  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  22.29 
 
 
1712 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  22.11 
 
 
1644 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  23.24 
 
 
1699 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  21.29 
 
 
1515 aa  225  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  21.27 
 
 
1691 aa  222  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  20.97 
 
 
1690 aa  196  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  23.01 
 
 
1686 aa  150  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  24.08 
 
 
1512 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  21.54 
 
 
1596 aa  89  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  20.27 
 
 
1494 aa  53.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  22.98 
 
 
1382 aa  45.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>