19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03800 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  100 
 
 
1686 aa  3362    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  27.2 
 
 
1650 aa  659    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  27.94 
 
 
1699 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  27.46 
 
 
1712 aa  657    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  26.63 
 
 
1644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  25.71 
 
 
1690 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  23.62 
 
 
1691 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  22.27 
 
 
1594 aa  339  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  22.21 
 
 
1532 aa  231  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  21.69 
 
 
1564 aa  219  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  22.51 
 
 
1446 aa  207  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  22.35 
 
 
1513 aa  197  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  19.98 
 
 
1493 aa  185  8.000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  27.39 
 
 
1596 aa  174  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  21.21 
 
 
1515 aa  171  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  23.43 
 
 
1491 aa  157  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  23.77 
 
 
1466 aa  147  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  22.33 
 
 
1494 aa  133  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  23.43 
 
 
1512 aa  121  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>