115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4569 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  99.08 
 
 
978 aa  1951    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  72.67 
 
 
1002 aa  1471    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  73.14 
 
 
1009 aa  1476    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4816  hypothetical protein  75.61 
 
 
983 aa  1492    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.682777  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  62.57 
 
 
1088 aa  856    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  59.49 
 
 
981 aa  1172    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3599  hypothetical protein  64.83 
 
 
960 aa  1299    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  100 
 
 
978 aa  1966    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  65.72 
 
 
1088 aa  854    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  96.01 
 
 
978 aa  1892    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  88.75 
 
 
978 aa  1720    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  29.2 
 
 
996 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  30.07 
 
 
1072 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1831  hypothetical protein  30.53 
 
 
1013 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85531  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2757  hypothetical protein  30.06 
 
 
1024 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0520624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  29.4 
 
 
1067 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  28.48 
 
 
1011 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  28.98 
 
 
1069 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0269  hypothetical protein  29.04 
 
 
1032 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509002  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0182  protein of unknown function DUF748  28.45 
 
 
954 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.966919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1600  hypothetical protein  29.45 
 
 
1073 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0485198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2578  hypothetical protein  28.26 
 
 
1076 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.380474  normal  0.372826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1502  hypothetical protein  29.85 
 
 
1119 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1563  hypothetical protein  28.44 
 
 
1087 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332771  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3419  hypothetical protein  28.91 
 
 
982 aa  362  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0573665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3550  hypothetical protein  29.41 
 
 
1074 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2039  hypothetical protein  28.08 
 
 
1061 aa  348  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0319037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3110  hypothetical protein  32.85 
 
 
1021 aa  348  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2679  hypothetical protein  27.09 
 
 
1065 aa  342  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  28.49 
 
 
1216 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1689  hypothetical protein  33.38 
 
 
1158 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.278214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1674  hypothetical protein  33.24 
 
 
1154 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.248662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2668  protein of unknown function DUF748  33.24 
 
 
1151 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.347388  normal  0.0417996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0156  hypothetical protein  28.88 
 
 
950 aa  333  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.968908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1711  hypothetical protein  33.48 
 
 
1161 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0766  protein of unknown function DUF748  28.4 
 
 
1260 aa  332  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.172009  normal  0.0206816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0837  protein of unknown function DUF748  28.14 
 
 
1266 aa  331  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457856  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1356  hypothetical protein  31.94 
 
 
1181 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1893  protein of unknown function DUF748  28.54 
 
 
1266 aa  323  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0539  protein of unknown function DUF748  28.37 
 
 
1208 aa  319  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0525  protein of unknown function DUF748  28.12 
 
 
1210 aa  317  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.616486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0955  hypothetical protein  27.27 
 
 
1040 aa  317  9e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  28.1 
 
 
1261 aa  315  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6890  protein of unknown function DUF748  25.49 
 
 
1247 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00167785  normal  0.283223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0680  hypothetical protein  27.73 
 
 
1187 aa  314  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  28.47 
 
 
1156 aa  308  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1595  hypothetical protein  34.11 
 
 
1128 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.419311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  26.67 
 
 
1098 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3077  hypothetical protein  28.14 
 
 
1041 aa  301  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266808  normal  0.0188552 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3628  hypothetical protein  29.1 
 
 
1304 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.715566  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3951  hypothetical protein  27.54 
 
 
1337 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  26.27 
 
 
1189 aa  295  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1287  protein of unknown function DUF748  24.94 
 
 
1080 aa  295  3e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.701723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3490  hypothetical protein  25.88 
 
 
953 aa  294  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4318  hypothetical protein  27.01 
 
 
1268 aa  291  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.939284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2935  hypothetical protein  24.67 
 
 
1283 aa  289  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  26.53 
 
 
1169 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3574  protein of unknown function DUF748  26.95 
 
 
957 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217437  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4779  hypothetical protein  24.71 
 
 
1277 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409952  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4825  hypothetical protein  25.14 
 
 
1268 aa  284  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3642  protein of unknown function DUF748  26.73 
 
 
955 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  27.05 
 
 
1200 aa  282  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5371  hypothetical protein  25.03 
 
 
1271 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.955656 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2832  hypothetical protein  29.39 
 
 
1135 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5368  hypothetical protein  25.09 
 
 
1275 aa  277  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5492  hypothetical protein  25.09 
 
 
1275 aa  277  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0602314  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0166  hypothetical protein  25.03 
 
 
1264 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.69232  normal  0.124721 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2165  hypothetical protein  26.27 
 
 
1382 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.418001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0857  hypothetical protein  26.66 
 
 
968 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.239267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2146  hypothetical protein  33.16 
 
 
1169 aa  269  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.848955 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3301  hypothetical protein  24.23 
 
 
1264 aa  267  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0877858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2234  hypothetical protein  29.04 
 
 
1260 aa  266  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  26.53 
 
 
1124 aa  266  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4953  hypothetical protein  26.61 
 
 
1281 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  29.16 
 
 
1144 aa  258  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0283  hypothetical protein  27.29 
 
 
1016 aa  249  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0632  hypothetical protein  26.02 
 
 
1197 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2904  hypothetical protein  29.65 
 
 
1298 aa  244  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.651688  normal  0.0396842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  23.4 
 
 
1261 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2114  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  26.74 
 
 
1112 aa  234  7.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  27.51 
 
 
1330 aa  229  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  24.66 
 
 
1235 aa  224  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2029  hypothetical protein  23.82 
 
 
1161 aa  222  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0861  transcription termination factor  30.19 
 
 
1081 aa  218  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1845  hypothetical protein  38.41 
 
 
1307 aa  217  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1758  hypothetical protein  38.41 
 
 
1348 aa  217  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0850  hypothetical protein  38.41 
 
 
1307 aa  217  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1140  hypothetical protein  38.41 
 
 
1307 aa  217  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.161671  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0321  hypothetical protein  38.41 
 
 
1318 aa  217  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2113  hypothetical protein  38.41 
 
 
1307 aa  217  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0410  hypothetical protein  38.06 
 
 
1321 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0200951  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1662  hypothetical protein  24.63 
 
 
1235 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2872  hypothetical protein  26.77 
 
 
1364 aa  214  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.325754  normal  0.590443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2990  hypothetical protein  26.78 
 
 
1295 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92179  normal  0.306203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3097  protein of unknown function DUF748  32.3 
 
 
1275 aa  197  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2026  hypothetical protein  29.65 
 
 
1354 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.368957  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1111  hypothetical protein  25.49 
 
 
806 aa  173  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.685916  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0312  hypothetical protein  25.22 
 
 
1022 aa  172  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.949397  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1357  hypothetical protein  27.78 
 
 
1025 aa  168  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  26.46 
 
 
1428 aa  161  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>