158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0261 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  100 
 
 		 1259 aa  2528    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1259 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1259 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1259 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  28.82 
 
 		 1259 aa  476  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  28.77 
 
 		 1259 aa  475  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1259 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1259 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1259 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  29 
 
 		 1259 aa  476  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1259 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1259 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  29.55 
 
 		 1249 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1259 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1259 aa  468  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1265 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1258 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1254 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  28.7 
 
 		 1246 aa  446  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  27.49 
 
 		 1254 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1256 aa  442  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1291 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1290 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1302 aa  425  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1340 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  30.67 
 
 		 1342 aa  422  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1305 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1312 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1319 aa  403  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  30.47 
 
 		 857 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1224 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1224 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1223 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1221 aa  370  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1328 aa  365  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1206 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1299 aa  363  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1226 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1297 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1221 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1283 aa  353  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1224 aa  349  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  28 
 
 		 1229 aa  344  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1226 aa  342  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1304 aa  342  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1344 aa  340  9e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1344 aa  339  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  23.65 
 
 		 1344 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1232 aa  335  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1341 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1305 aa  333  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1255 aa  331  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1290 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1355 aa  307  8.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1319 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1174 aa  305  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1310 aa  290  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1174 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1262 aa  283  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1385 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1352 aa  270  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1402 aa  264  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1353 aa  264  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1398 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1449 aa  264  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1773 aa  254  1e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  26.06 
 
 		 1382 aa  251  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1664 aa  233  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1664 aa  230  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  30.09 
 
 		 982 aa  214  9e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1273 aa  180  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  23.34 
 
 		 1273 aa  180  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  27.92 
 
 		 1025 aa  160  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  23.23 
 
 		 1285 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23.63 
 
 		 1285 aa  160  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.18 
 
 		 1243 aa  146  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1308 aa  129  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1325 aa  118  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  24.62 
 
 		 1426 aa  112  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1434 aa  110  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1056 aa  108  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  25 
 
 		 1485 aa  107  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  25.06 
 
 		 929 aa  107  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1184 aa  106  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  27.92 
 
 		 1184 aa  106  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  24.94 
 
 		 1485 aa  105  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  25.06 
 
 		 929 aa  105  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1453 aa  105  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1443 aa  103  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1377 aa  102  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  24.67 
 
 		 1359 aa  102  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1473 aa  97.8  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  21.95 
 
 		 846 aa  95.5  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  21.73 
 
 		 846 aa  92  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1332 aa  92  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1448 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1292 aa  85.9  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1380 aa  85.5  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  27.92 
 
 		 1378 aa  85.5  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1361 aa  84.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>