41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2878 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4575  hypothetical protein  35.13 
 
 
1831 aa  1063    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.427026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0240  hypothetical protein  37.39 
 
 
2049 aa  848    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.930824  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2878  hypothetical protein  100 
 
 
1829 aa  3562    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.41175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4219  protein of unknown function DUF490  29.89 
 
 
1846 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2994  protein of unknown function DUF490  31.7 
 
 
1813 aa  902    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4258  protein of unknown function DUF490  29.78 
 
 
1846 aa  786    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.013451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4866  protein of unknown function DUF490  34.97 
 
 
1601 aa  580  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0342  hypothetical protein  30.76 
 
 
2322 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5316  protein of unknown function DUF490  27.75 
 
 
1982 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4502  protein of unknown function DUF490  25.94 
 
 
1981 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4440  protein of unknown function DUF490  25.79 
 
 
1981 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1788  hypothetical protein  28.61 
 
 
1568 aa  410  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.420849  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2674  protein of unknown function DUF490  24.82 
 
 
1975 aa  315  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0447  protein of unknown function DUF490  23.32 
 
 
1887 aa  304  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3430  protein of unknown function DUF490  24.9 
 
 
1975 aa  215  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0925  hypothetical protein  24.88 
 
 
1475 aa  167  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06451  hypothetical protein  22.99 
 
 
1319 aa  165  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0025  hypothetical protein  22.62 
 
 
1319 aa  163  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40935  predicted protein  21.66 
 
 
926 aa  148  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240067 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1024  hypothetical protein  25.43 
 
 
1473 aa  142  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.939062  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18431  hypothetical protein  22.6 
 
 
1478 aa  137  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10621  hypothetical protein  22.57 
 
 
1326 aa  132  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.860868  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06451  hypothetical protein  23.33 
 
 
1298 aa  115  9e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06541  hypothetical protein  23.22 
 
 
1315 aa  103  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06151  hypothetical protein  21.79 
 
 
1296 aa  92.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  22.15 
 
 
1462 aa  60.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  23.94 
 
 
2140 aa  55.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  24.17 
 
 
1466 aa  54.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0589  hypothetical protein  20.2 
 
 
1360 aa  54.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  21.82 
 
 
1705 aa  53.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  23.37 
 
 
1369 aa  53.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  21.28 
 
 
1256 aa  50.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  23.44 
 
 
2032 aa  49.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  24.89 
 
 
1392 aa  49.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  22.15 
 
 
1869 aa  49.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  21.19 
 
 
1448 aa  47.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  23.91 
 
 
1441 aa  47  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.85 
 
 
1308 aa  47.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  22.18 
 
 
846 aa  47  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2256  protein of unknown function DUF490  24.05 
 
 
2780 aa  45.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  22.2 
 
 
587 aa  45.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>