168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2482 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  100 
 
 
1462 aa  2852    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  28.26 
 
 
1500 aa  291  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  25.1 
 
 
1405 aa  204  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  25.91 
 
 
1428 aa  197  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  25.88 
 
 
1423 aa  195  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  27.29 
 
 
1448 aa  187  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  25.08 
 
 
1489 aa  184  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  25.02 
 
 
1869 aa  184  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  26.03 
 
 
1441 aa  175  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  29.46 
 
 
1395 aa  175  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  25.83 
 
 
1463 aa  172  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  30.56 
 
 
1550 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  25.83 
 
 
1463 aa  169  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  25.64 
 
 
1362 aa  168  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  26.28 
 
 
1487 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  27.58 
 
 
1530 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  26.61 
 
 
1550 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  28.43 
 
 
1448 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  28.15 
 
 
2140 aa  166  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  31.71 
 
 
1396 aa  163  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  25.4 
 
 
1451 aa  163  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  27.16 
 
 
2032 aa  160  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.05 
 
 
1392 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  29.81 
 
 
1084 aa  153  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  29.18 
 
 
1276 aa  152  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  26.06 
 
 
1937 aa  152  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  29.18 
 
 
1276 aa  152  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  30.75 
 
 
1783 aa  151  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  23.22 
 
 
1538 aa  147  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  27.45 
 
 
1398 aa  147  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  27.11 
 
 
1276 aa  145  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  25.66 
 
 
1270 aa  145  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  24.53 
 
 
1424 aa  141  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  25.5 
 
 
1404 aa  139  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  26.88 
 
 
1406 aa  138  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  26.76 
 
 
1510 aa  138  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  27.29 
 
 
1515 aa  132  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  27.33 
 
 
1319 aa  128  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  27.33 
 
 
1501 aa  125  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  27.3 
 
 
1578 aa  123  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  27.14 
 
 
1335 aa  115  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  26.37 
 
 
1206 aa  110  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  26.42 
 
 
1505 aa  108  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  26.43 
 
 
1360 aa  106  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  26.43 
 
 
1358 aa  105  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.39 
 
 
1361 aa  104  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  26.81 
 
 
1507 aa  102  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  26 
 
 
1372 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  26.57 
 
 
1507 aa  101  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  26.68 
 
 
1504 aa  101  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  26 
 
 
1372 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  26 
 
 
1372 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  26.17 
 
 
1372 aa  101  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  26 
 
 
1372 aa  101  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  26 
 
 
1372 aa  100  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25 
 
 
1308 aa  98.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.12 
 
 
1304 aa  97.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  25.86 
 
 
1372 aa  97.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.25 
 
 
1184 aa  97.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.25 
 
 
1184 aa  97.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  24.85 
 
 
1256 aa  97.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  26.25 
 
 
1352 aa  95.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25.64 
 
 
1346 aa  94  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.59 
 
 
1346 aa  93.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  22.19 
 
 
1443 aa  92.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.42 
 
 
1262 aa  92.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  26.75 
 
 
1434 aa  92.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  25.56 
 
 
1360 aa  91.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.99 
 
 
1319 aa  90.9  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  25.11 
 
 
1375 aa  90.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  25.97 
 
 
1347 aa  90.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  26.33 
 
 
1297 aa  90.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  23.22 
 
 
1290 aa  90.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  21.78 
 
 
929 aa  90.1  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  25.97 
 
 
1347 aa  89.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  22.69 
 
 
1705 aa  89.4  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  24.8 
 
 
1056 aa  89  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  21.78 
 
 
929 aa  89  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  25.82 
 
 
1347 aa  86.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.21 
 
 
1377 aa  86.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  24.1 
 
 
1304 aa  85.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.68 
 
 
1359 aa  85.5  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.33 
 
 
1325 aa  81.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  21.92 
 
 
1369 aa  80.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.05 
 
 
1304 aa  80.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  24.36 
 
 
1448 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  24.93 
 
 
1453 aa  80.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  25 
 
 
1299 aa  79.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.07 
 
 
1226 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  25.18 
 
 
1355 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  24.32 
 
 
1382 aa  76.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  23.89 
 
 
1223 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  24.88 
 
 
1378 aa  75.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.98 
 
 
1229 aa  74.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  24.79 
 
 
1292 aa  74.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  24.58 
 
 
1380 aa  73.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  22.99 
 
 
1299 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  23.41 
 
 
1305 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  23.33 
 
 
1401 aa  73.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  24.03 
 
 
846 aa  72.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>