162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4828 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  40.83 
 
 		 1398 aa  895    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1406 aa  644    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  100 
 
 		 1392 aa  2709    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1463 aa  173  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  29.69 
 
 		 1441 aa  172  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  27.76 
 
 		 1463 aa  171  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1428 aa  171  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1396 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  25.57 
 
 		 1405 aa  166  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1451 aa  166  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1869 aa  164  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1395 aa  157  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1423 aa  157  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1362 aa  156  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  28.41 
 
 		 1550 aa  155  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1487 aa  154  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1462 aa  152  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  27.92 
 
 		 2140 aa  145  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  27.84 
 
 		 2032 aa  141  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1489 aa  140  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  37.36 
 
 		 1783 aa  139  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  26.56 
 
 		 1530 aa  138  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  33.71 
 
 		 1937 aa  136  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1404 aa  135  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1448 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1276 aa  133  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  26.03 
 
 		 1448 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1276 aa  128  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1515 aa  127  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1550 aa  127  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1276 aa  128  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1270 aa  125  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1510 aa  125  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1501 aa  120  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1538 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  35.68 
 
 		 1084 aa  114  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1578 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1319 aa  112  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1335 aa  100  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1308 aa  98.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  27.82 
 
 		 1424 aa  95.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1056 aa  91.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1346 aa  87.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1453 aa  85.5  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1224 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1206 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1224 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1434 aa  77.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1223 aa  75.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1226 aa  75.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1221 aa  75.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1504 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1361 aa  74.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1221 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1443 aa  74.3  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.54 
 
 		 1359 aa  73.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1369 aa  73.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  30.95 
 
 		 1507 aa  72  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1259 aa  72  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1232 aa  72  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  30.95 
 
 		 1507 aa  72  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1256 aa  71.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1401 aa  70.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  24.23 
 
 		 1378 aa  70.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.18 
 
 		 1485 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1319 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1353 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1352 aa  69.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1226 aa  68.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  28.01 
 
 		 1304 aa  68.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1377 aa  67.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1317 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  28.44 
 
 		 1304 aa  67.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1292 aa  67.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  22.49 
 
 		 1485 aa  67.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1505 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1380 aa  67  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1229 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1290 aa  66.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  25 
 
 		 1473 aa  65.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  23.31 
 
 		 1243 aa  65.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1224 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1304 aa  63.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  26.84 
 
 		 1299 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1218 aa  63.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1332 aa  63.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1325 aa  62.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3491  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1215 aa  62.4  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1297 aa  61.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  25.44 
 
 		 1426 aa  60.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1299 aa  60.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1305 aa  60.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  24.23 
 
 		 1515 aa  59.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1453 aa  58.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.46 
 
 		 1025 aa  57.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1392 aa  57.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1283 aa  58.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.82 
 
 		 1285 aa  57.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1290 aa  57  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>