140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3382 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1084 aa  2080    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  43.38 
 
 
1276 aa  399  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  43.56 
 
 
1276 aa  399  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  39.86 
 
 
1276 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  35.65 
 
 
1206 aa  299  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  34.41 
 
 
1335 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  30.67 
 
 
1501 aa  279  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  37.45 
 
 
1538 aa  247  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  36.23 
 
 
1515 aa  247  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  36.98 
 
 
1578 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  35.51 
 
 
1510 aa  235  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  30.69 
 
 
1869 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  37.08 
 
 
1404 aa  226  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  32.31 
 
 
1550 aa  217  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  32.48 
 
 
2140 aa  199  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  30.73 
 
 
2032 aa  197  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  32.72 
 
 
1451 aa  195  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  31.74 
 
 
1428 aa  188  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  33.41 
 
 
1530 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  31.33 
 
 
1423 aa  176  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  30.49 
 
 
1441 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  31.04 
 
 
1463 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  34.18 
 
 
1448 aa  164  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  30.25 
 
 
1463 aa  162  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  28.32 
 
 
1487 aa  161  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  27.94 
 
 
1489 aa  160  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  28.81 
 
 
1462 aa  147  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  32.71 
 
 
1406 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  27.19 
 
 
1405 aa  137  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  31.18 
 
 
1424 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  32.11 
 
 
1448 aa  135  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  29.89 
 
 
1500 aa  131  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  29.86 
 
 
1396 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  36.32 
 
 
1398 aa  129  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  28.67 
 
 
1319 aa  124  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  27.88 
 
 
1270 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  30 
 
 
1937 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  30 
 
 
1783 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  35.68 
 
 
1392 aa  109  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  26.95 
 
 
1362 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.19 
 
 
1550 aa  100  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.95 
 
 
1395 aa  87  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  28.34 
 
 
1352 aa  82.4  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  25.12 
 
 
1224 aa  74.7  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  32.91 
 
 
1434 aa  71.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  24.6 
 
 
1377 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.34 
 
 
1226 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  24.32 
 
 
1259 aa  67.4  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.82 
 
 
1221 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  25.2 
 
 
1218 aa  64.7  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  26.25 
 
 
1283 aa  64.3  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.59 
 
 
1221 aa  64.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  23.84 
 
 
1229 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  27.88 
 
 
1292 aa  62  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  26.82 
 
 
1359 aa  62  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  23.24 
 
 
1226 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  21.59 
 
 
1256 aa  61.6  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  26.46 
 
 
1243 aa  61.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  23.7 
 
 
1255 aa  60.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  25.26 
 
 
1473 aa  60.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  25.34 
 
 
1507 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  25.34 
 
 
1507 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  27.62 
 
 
1265 aa  60.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  23.67 
 
 
1224 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  34.62 
 
 
1290 aa  60.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  23.43 
 
 
1224 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  23.43 
 
 
1206 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  27.56 
 
 
1380 aa  59.3  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.89 
 
 
1232 aa  58.9  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  27.48 
 
 
1443 aa  58.2  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17710  hypothetical protein  22.27 
 
 
1430 aa  57.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  26.88 
 
 
1378 aa  57  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  37.72 
 
 
1254 aa  56.2  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  26.52 
 
 
1485 aa  56.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.6 
 
 
1308 aa  55.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.33 
 
 
1056 aa  55.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  24.04 
 
 
1504 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  23.08 
 
 
1317 aa  53.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  22.31 
 
 
1174 aa  53.5  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  25.65 
 
 
1453 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  26.46 
 
 
1025 aa  53.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  24.77 
 
 
1346 aa  53.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  26.76 
 
 
1304 aa  52.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  27.5 
 
 
1285 aa  53.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  30.88 
 
 
1259 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  30.88 
 
 
1259 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  30.88 
 
 
1259 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  30.88 
 
 
1259 aa  52.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  30.88 
 
 
1259 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  22.35 
 
 
1223 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  23.67 
 
 
1664 aa  52.4  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  26.98 
 
 
1304 aa  52.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  24.89 
 
 
1505 aa  52.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  28.03 
 
 
1426 aa  52  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  27.31 
 
 
1382 aa  52  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  28.71 
 
 
1319 aa  52  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  24.76 
 
 
1361 aa  51.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  25.32 
 
 
1254 aa  51.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  23.2 
 
 
1664 aa  50.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  31.53 
 
 
1485 aa  49.7  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>