143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1103 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  100 
 
 		 1398 aa  2716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  40.97 
 
 		 1392 aa  890    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1406 aa  568  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1428 aa  177  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1423 aa  172  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1396 aa  160  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  28.74 
 
 		 1441 aa  152  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  28.04 
 
 		 1463 aa  152  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1395 aa  149  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1276 aa  147  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1276 aa  147  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1869 aa  145  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1276 aa  145  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1451 aa  142  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  28.24 
 
 		 1550 aa  141  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  26.59 
 
 		 1405 aa  140  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1362 aa  140  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1462 aa  138  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1489 aa  136  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  42.53 
 
 		 1937 aa  135  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  29.16 
 
 		 1404 aa  131  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  27.51 
 
 		 2140 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  30.02 
 
 		 1084 aa  129  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1501 aa  127  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1783 aa  127  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1487 aa  127  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  26.74 
 
 		 2032 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1550 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1448 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  29.66 
 
 		 1530 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1510 aa  120  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1515 aa  119  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1578 aa  116  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1270 aa  115  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  30.64 
 
 		 1319 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1538 aa  113  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  29.48 
 
 		 1424 aa  106  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  25.31 
 
 		 1448 aa  99.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1206 aa  95.1  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1401 aa  92  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1453 aa  90.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1392 aa  87  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1335 aa  85.1  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1346 aa  83.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1443 aa  82.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1361 aa  80.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.5 
 
 		 1359 aa  79.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1369 aa  75.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1317 aa  75.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1377 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1453 aa  74.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  28.91 
 
 		 1025 aa  74.3  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  25.72 
 
 		 1378 aa  74.3  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1434 aa  70.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1473 aa  70.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.93 
 
 		 1285 aa  69.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1056 aa  68.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1500 aa  68.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1463 aa  66.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23.86 
 
 		 1285 aa  63.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25 
 
 		 1229 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1304 aa  63.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1256 aa  64.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1380 aa  63.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  28.69 
 
 		 1426 aa  63.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1218 aa  63.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1308 aa  63.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1259 aa  62.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1305 aa  63.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25.94 
 
 		 1243 aa  62.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1273 aa  62.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  25.05 
 
 		 1273 aa  62.4  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1325 aa  62.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1448 aa  62  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1290 aa  60.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1372 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1226 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1449 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1372 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1372 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1372 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1372 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1372 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  23.8 
 
 		 1304 aa  60.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  24.03 
 
 		 1299 aa  59.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1372 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1221 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  30 
 
 		 1385 aa  59.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1398 aa  59.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  23.42 
 
 		 1304 aa  59.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1224 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1347 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1402 aa  58.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1221 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1360 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1353 aa  58.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1347 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1297 aa  58.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1355 aa  57.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1224 aa  57  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>