169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1217 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  39.08 
 
 		 1359 aa  767    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  42.03 
 
 		 1292 aa  815    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 1361 aa  2614    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  39.17 
 
 		 1378 aa  717    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1473 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  70.31 
 
 		 1346 aa  1704    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  39.18 
 
 		 1380 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  37.45 
 
 		 1453 aa  692    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1443 aa  621  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  27.52 
 
 		 1299 aa  276  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  34.94 
 
 		 1453 aa  270  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1056 aa  242  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  33.39 
 
 		 1243 aa  241  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1401 aa  225  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1372 aa  221  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1372 aa  221  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1372 aa  221  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1372 aa  221  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1372 aa  221  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  31.25 
 
 		 1304 aa  220  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  31.42 
 
 		 1304 aa  221  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1372 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1372 aa  220  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1448 aa  214  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  28.83 
 
 		 1443 aa  213  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1218 aa  212  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1435 aa  207  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1346 aa  206  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1375 aa  207  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1392 aa  204  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1358 aa  201  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1360 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1347 aa  194  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1360 aa  193  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1347 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1347 aa  192  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  29.16 
 
 		 1332 aa  186  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1308 aa  164  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1352 aa  159  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1262 aa  158  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1184 aa  132  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.86 
 
 		 1184 aa  132  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  25.4 
 
 		 1254 aa  129  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1312 aa  129  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1305 aa  129  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1291 aa  129  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1226 aa  128  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1232 aa  126  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1325 aa  127  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1319 aa  124  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1254 aa  124  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  26.38 
 
 		 1382 aa  124  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1224 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1297 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1340 aa  122  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1290 aa  122  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  25.47 
 
 		 1342 aa  121  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1224 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1224 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1223 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1221 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1206 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1221 aa  119  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1229 aa  119  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1259 aa  119  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1259 aa  118  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1259 aa  118  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1259 aa  118  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1259 aa  118  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1226 aa  118  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  26.49 
 
 		 1249 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  27.14 
 
 		 1025 aa  115  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1265 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  24.29 
 
 		 1246 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1290 aa  113  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  26.26 
 
 		 1485 aa  113  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1319 aa  113  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1462 aa  111  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.68 
 
 		 1485 aa  111  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  32.66 
 
 		 1283 aa  110  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  27.75 
 
 		 1285 aa  110  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1174 aa  108  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  26.9 
 
 		 1285 aa  107  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.14 
 
 		 1550 aa  107  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1273 aa  106  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  26.61 
 
 		 1273 aa  106  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1256 aa  105  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1258 aa  104  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1353 aa  103  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1305 aa  102  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1550 aa  101  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1299 aa  101  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1344 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1259 aa  100  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  25.69 
 
 		 1344 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1259 aa  100  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1259 aa  100  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1344 aa  100  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  23.82 
 
 		 857 aa  100  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1259 aa  99.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>