171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3646 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  67.65 
 
 		 1224 aa  1649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  69.2 
 
 		 1229 aa  1706    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  69.28 
 
 		 1226 aa  1723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  100 
 
 		 1224 aa  2432    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  68.39 
 
 		 1223 aa  1661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  62.12 
 
 		 1221 aa  1532    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  38.76 
 
 		 1255 aa  849    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  68.14 
 
 		 1224 aa  1662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  55.32 
 
 		 1232 aa  1345    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  57.63 
 
 		 1226 aa  1376    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  68.56 
 
 		 1206 aa  1641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  61.62 
 
 		 1221 aa  1516    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  29.27 
 
 		 1249 aa  383  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1259 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1259 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1259 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1259 aa  377  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1283 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  33.01 
 
 		 1174 aa  376  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1259 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1259 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  27.58 
 
 		 1259 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1259 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1259 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1259 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1259 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1259 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  29.52 
 
 		 1246 aa  366  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1259 aa  365  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  29.91 
 
 		 1342 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1291 aa  363  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1305 aa  362  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1312 aa  362  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1259 aa  362  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1340 aa  360  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  29.84 
 
 		 857 aa  360  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1258 aa  356  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1265 aa  349  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1256 aa  343  9e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1262 aa  337  5.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  29.27 
 
 		 1254 aa  334  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1254 aa  334  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1290 aa  328  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1297 aa  324  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1319 aa  323  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1299 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1290 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1352 aa  312  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  30.7 
 
 		 1382 aa  308  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1344 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1344 aa  302  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1664 aa  296  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  27.98 
 
 		 1344 aa  296  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1341 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1305 aa  290  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1664 aa  288  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1773 aa  287  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1328 aa  281  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1304 aa  278  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1319 aa  271  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1385 aa  260  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  29.85 
 
 		 1398 aa  254  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1402 aa  253  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1449 aa  252  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1302 aa  243  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1353 aa  239  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1174 aa  235  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1355 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  28.62 
 
 		 1273 aa  227  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  28.59 
 
 		 1273 aa  223  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  27.49 
 
 		 1285 aa  224  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1310 aa  205  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  24.88 
 
 		 1285 aa  204  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25.45 
 
 		 1243 aa  197  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  24.67 
 
 		 1025 aa  180  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1308 aa  161  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1325 aa  155  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1184 aa  155  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  26.19 
 
 		 1184 aa  155  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  22.12 
 
 		 982 aa  153  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1377 aa  153  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  26.64 
 
 		 1485 aa  147  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  28.47 
 
 		 1485 aa  147  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  23.58 
 
 		 1304 aa  131  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  24.61 
 
 		 1426 aa  129  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  26.62 
 
 		 1359 aa  127  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  23.43 
 
 		 1304 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1453 aa  122  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  25.69 
 
 		 846 aa  121  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1401 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  24.37 
 
 		 1299 aa  119  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1346 aa  117  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  26.23 
 
 		 1378 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  23.97 
 
 		 846 aa  113  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1332 aa  112  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1453 aa  112  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  23.28 
 
 		 1441 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1380 aa  111  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.03 
 
 		 929 aa  110  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  23.43 
 
 		 1463 aa  110  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>