156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2437 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  43.25 
 
 
1385 aa  1118    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  43.26 
 
 
1344 aa  1137    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  36.86 
 
 
1355 aa  881    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  47.1 
 
 
1290 aa  1226    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  48.88 
 
 
1402 aa  775    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  41.11 
 
 
1398 aa  1077    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  39.12 
 
 
1304 aa  1017    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  49.13 
 
 
1449 aa  781    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  38.55 
 
 
1297 aa  920    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  43.43 
 
 
1341 aa  1135    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  45.58 
 
 
1299 aa  1156    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  43.99 
 
 
1305 aa  1143    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  43.7 
 
 
1344 aa  1140    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  46.67 
 
 
1319 aa  1221    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  100 
 
 
1353 aa  2746    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  43.63 
 
 
1344 aa  1140    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  25.85 
 
 
1259 aa  415  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  26.42 
 
 
1258 aa  415  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  25.96 
 
 
1259 aa  412  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  25.7 
 
 
1259 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  25.85 
 
 
1259 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  25.78 
 
 
1259 aa  412  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  25.7 
 
 
1259 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  25.65 
 
 
1259 aa  410  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  25.59 
 
 
1259 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  25.59 
 
 
1259 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  25.59 
 
 
1259 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  25.52 
 
 
1259 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  25.5 
 
 
1259 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  25.52 
 
 
1259 aa  406  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  26.01 
 
 
1291 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  26.12 
 
 
1256 aa  400  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  25.65 
 
 
1312 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  25.71 
 
 
1305 aa  397  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  26.49 
 
 
1254 aa  393  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  24.79 
 
 
1249 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  25.59 
 
 
1290 aa  379  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.96 
 
 
1340 aa  375  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  24.73 
 
 
1246 aa  377  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  24.68 
 
 
1342 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  24.72 
 
 
1265 aa  360  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  24.91 
 
 
1254 aa  349  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  25.81 
 
 
1283 aa  345  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  24.44 
 
 
1319 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  25.2 
 
 
1310 aa  337  7e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  27.7 
 
 
857 aa  328  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  23.06 
 
 
1328 aa  315  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  25.02 
 
 
1259 aa  293  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  25.51 
 
 
1174 aa  291  5.0000000000000004e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  26.07 
 
 
1221 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25.62 
 
 
1221 aa  280  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  26.17 
 
 
1352 aa  269  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  27.42 
 
 
1206 aa  270  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  27.27 
 
 
1223 aa  268  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  27.45 
 
 
1224 aa  267  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.7 
 
 
1226 aa  261  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  27.76 
 
 
1229 aa  261  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  28.05 
 
 
1226 aa  261  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  28.42 
 
 
1224 aa  258  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  27.16 
 
 
1224 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  24.47 
 
 
1302 aa  251  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  27.52 
 
 
1232 aa  245  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  23.5 
 
 
1382 aa  228  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  25.53 
 
 
1174 aa  222  3.9999999999999997e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  23.72 
 
 
1262 aa  215  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.98 
 
 
1255 aa  206  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  24.32 
 
 
1664 aa  191  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.1 
 
 
1025 aa  185  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  24.26 
 
 
1664 aa  184  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  23.45 
 
 
1773 aa  181  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  23.26 
 
 
982 aa  167  2.0000000000000002e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23.68 
 
 
1285 aa  167  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  22.87 
 
 
1285 aa  162  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.23 
 
 
1273 aa  160  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.23 
 
 
1273 aa  158  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  26.89 
 
 
1325 aa  140  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.97 
 
 
1377 aa  125  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.42 
 
 
1184 aa  119  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.42 
 
 
1184 aa  119  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  26.92 
 
 
1453 aa  112  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  22.98 
 
 
929 aa  111  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  22.76 
 
 
929 aa  111  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  25.3 
 
 
1401 aa  110  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  26.07 
 
 
1308 aa  110  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  26.61 
 
 
1346 aa  105  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.89 
 
 
1361 aa  105  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.61 
 
 
1359 aa  105  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  22.65 
 
 
1485 aa  104  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  26.58 
 
 
1218 aa  103  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  27.54 
 
 
1380 aa  102  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  26.67 
 
 
1378 aa  102  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  26.71 
 
 
1426 aa  100  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  23.75 
 
 
846 aa  97.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  27.02 
 
 
1056 aa  97.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  24.33 
 
 
846 aa  95.9  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  25.26 
 
 
1304 aa  95.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  22.82 
 
 
1443 aa  95.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.06 
 
 
1485 aa  94.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  25.26 
 
 
1304 aa  93.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.88 
 
 
1448 aa  92.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>