165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1750 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1025 aa  2043    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  28.21 
 
 
1352 aa  273  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.52 
 
 
1262 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26.32 
 
 
1265 aa  207  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  25.95 
 
 
1382 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.33 
 
 
1223 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.49 
 
 
1224 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  25.85 
 
 
1254 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.3 
 
 
1224 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.18 
 
 
1206 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  26.76 
 
 
1283 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  24.94 
 
 
1285 aa  196  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  26.06 
 
 
1319 aa  195  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.24 
 
 
1290 aa  194  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  25.63 
 
 
1232 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  23.85 
 
 
1290 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.21 
 
 
1285 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  25.33 
 
 
1273 aa  189  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25.27 
 
 
1226 aa  188  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  26.28 
 
 
1246 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  25.09 
 
 
1273 aa  185  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.76 
 
 
1224 aa  183  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.98 
 
 
1226 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  24.77 
 
 
1249 aa  180  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  24.78 
 
 
1259 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.75 
 
 
1221 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  24.78 
 
 
1259 aa  178  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.6 
 
 
1221 aa  179  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  24.78 
 
 
1259 aa  178  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.79 
 
 
1229 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  24.87 
 
 
1259 aa  177  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  24.65 
 
 
1259 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  24.48 
 
 
1174 aa  174  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  23.87 
 
 
1305 aa  172  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  23.87 
 
 
1291 aa  171  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  22.95 
 
 
1319 aa  171  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  23.87 
 
 
1312 aa  171  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  23.93 
 
 
1340 aa  171  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  24.84 
 
 
1297 aa  170  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.72 
 
 
1259 aa  170  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  23.39 
 
 
1259 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.44 
 
 
1259 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.26 
 
 
1259 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  23.26 
 
 
1259 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  23.21 
 
 
857 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.39 
 
 
1259 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.14 
 
 
1259 aa  169  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  23.67 
 
 
1256 aa  168  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  22.74 
 
 
1254 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.69 
 
 
1308 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.14 
 
 
1259 aa  165  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  29.43 
 
 
1304 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.19 
 
 
1305 aa  163  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  27.92 
 
 
1259 aa  161  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  24.57 
 
 
1255 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  23.1 
 
 
1342 aa  158  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.84 
 
 
1353 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  23.97 
 
 
1258 aa  157  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.97 
 
 
1299 aa  156  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  22.04 
 
 
1344 aa  155  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  21.91 
 
 
1344 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  27.63 
 
 
1174 aa  153  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  22.04 
 
 
1344 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  24.12 
 
 
1402 aa  151  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  23.58 
 
 
1325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  22.18 
 
 
1341 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  24.15 
 
 
1398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  24.4 
 
 
1449 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  23.36 
 
 
1385 aa  148  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  25.75 
 
 
1304 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  26.21 
 
 
1304 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  25.47 
 
 
1310 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.08 
 
 
1377 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  25.78 
 
 
1426 aa  142  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  23.84 
 
 
846 aa  140  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.91 
 
 
1243 aa  140  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  22.76 
 
 
1328 aa  139  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  23.48 
 
 
846 aa  138  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  25.32 
 
 
1299 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  24.14 
 
 
1355 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  24.02 
 
 
1401 aa  131  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  25.43 
 
 
1773 aa  129  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  24.1 
 
 
1448 aa  128  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  23.75 
 
 
1664 aa  125  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  24.41 
 
 
1372 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  24.29 
 
 
1372 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.61 
 
 
929 aa  122  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  23.26 
 
 
1664 aa  122  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  24.29 
 
 
1372 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  24.29 
 
 
1372 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  24.29 
 
 
1372 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  24.29 
 
 
1372 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  24.61 
 
 
929 aa  121  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  24.16 
 
 
1372 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  29.03 
 
 
1434 aa  119  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  23.19 
 
 
1435 aa  118  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  26.76 
 
 
1302 aa  117  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.87 
 
 
1485 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  28.26 
 
 
1375 aa  114  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  24.23 
 
 
1443 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>