166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0461 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  100 
 
 
1218 aa  2387    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  35.46 
 
 
1426 aa  367  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  37.11 
 
 
1243 aa  262  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  34.1 
 
 
1332 aa  252  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  28.31 
 
 
1299 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  32.09 
 
 
1401 aa  229  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  32.49 
 
 
1056 aa  228  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  32.05 
 
 
1443 aa  224  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  32.02 
 
 
1372 aa  224  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  32.02 
 
 
1372 aa  224  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  32.02 
 
 
1372 aa  224  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  32.02 
 
 
1372 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  32.02 
 
 
1372 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  32.02 
 
 
1372 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  32.39 
 
 
1346 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  32.21 
 
 
1375 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  31.84 
 
 
1372 aa  221  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  31.61 
 
 
1435 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  32.12 
 
 
1448 aa  218  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  32.14 
 
 
1358 aa  217  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  32.41 
 
 
1360 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  32.14 
 
 
1360 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  32.52 
 
 
1347 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  26.85 
 
 
1392 aa  213  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  32.52 
 
 
1347 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  32.52 
 
 
1347 aa  211  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  31.08 
 
 
1304 aa  211  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  31.29 
 
 
1304 aa  208  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  32.6 
 
 
1473 aa  201  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  31.21 
 
 
1453 aa  198  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  30.47 
 
 
1453 aa  197  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  30.8 
 
 
1359 aa  195  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  31.28 
 
 
1346 aa  194  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  30.56 
 
 
1443 aa  191  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  31.56 
 
 
1361 aa  189  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  30.76 
 
 
1380 aa  184  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  31.27 
 
 
1378 aa  184  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  30.79 
 
 
1434 aa  178  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.8 
 
 
1206 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.61 
 
 
1224 aa  171  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.59 
 
 
1224 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.7 
 
 
1223 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  29.67 
 
 
1352 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  24.78 
 
 
1255 aa  142  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  29.71 
 
 
1377 aa  140  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  28.38 
 
 
1325 aa  131  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  29.55 
 
 
1485 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  32.01 
 
 
1308 aa  125  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  28.27 
 
 
1485 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.04 
 
 
1226 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  27.08 
 
 
1344 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  27.08 
 
 
1344 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  25.44 
 
 
1382 aa  112  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.59 
 
 
1262 aa  110  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  29.82 
 
 
1283 aa  110  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  26.71 
 
 
1341 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  26.9 
 
 
1344 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  28.17 
 
 
1310 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.62 
 
 
1184 aa  105  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.62 
 
 
1184 aa  105  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  29.43 
 
 
1285 aa  105  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  27.95 
 
 
1224 aa  104  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  26.86 
 
 
1025 aa  102  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  28.37 
 
 
1259 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  28.37 
 
 
1259 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  28.37 
 
 
1259 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  28.37 
 
 
1259 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  28.37 
 
 
1259 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  28.23 
 
 
1292 aa  99.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  25.61 
 
 
1398 aa  99.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  25.05 
 
 
1319 aa  99.4  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  25.6 
 
 
1402 aa  99  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  21.77 
 
 
1290 aa  97.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  26.03 
 
 
1304 aa  97.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  27.98 
 
 
1221 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  25.62 
 
 
1449 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  27.42 
 
 
1305 aa  96.3  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.95 
 
 
1319 aa  96.3  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  25.29 
 
 
1385 aa  95.9  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  26.65 
 
 
1226 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  25.84 
 
 
1273 aa  95.9  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  25.84 
 
 
1273 aa  95.9  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.68 
 
 
1221 aa  95.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  23.46 
 
 
1254 aa  94.7  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  27.72 
 
 
1258 aa  94  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.07 
 
 
1229 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  26.46 
 
 
1340 aa  92.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  26.87 
 
 
1353 aa  92  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  21.79 
 
 
1259 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  26.02 
 
 
846 aa  91.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  24.3 
 
 
1299 aa  91.7  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  22.94 
 
 
1312 aa  91.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  22.94 
 
 
1305 aa  90.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  22.94 
 
 
1291 aa  90.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  21.79 
 
 
1259 aa  90.1  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  25.31 
 
 
846 aa  89.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  21.79 
 
 
1259 aa  89.4  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  21.79 
 
 
1259 aa  89  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  22.47 
 
 
1259 aa  88.6  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  22.47 
 
 
857 aa  88.6  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>