171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1593 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  100 
 
 		 1292 aa  2495    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  41.93 
 
 		 1361 aa  775    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  42.9 
 
 		 1378 aa  852    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  39.15 
 
 		 1473 aa  807    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  43.21 
 
 		 1346 aa  858    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  42.77 
 
 		 1380 aa  844    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1453 aa  813    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  42.48 
 
 		 1359 aa  915    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  37.7 
 
 		 1443 aa  768    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  36.92 
 
 		 1434 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1453 aa  275  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1056 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1401 aa  223  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  27.97 
 
 		 1304 aa  221  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1372 aa  220  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1372 aa  218  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  28.23 
 
 		 1299 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1372 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1372 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1372 aa  218  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1372 aa  218  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1372 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  30.17 
 
 		 1304 aa  209  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  32.15 
 
 		 1443 aa  209  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1392 aa  205  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1375 aa  204  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1448 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1435 aa  201  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1332 aa  198  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  29.55 
 
 		 1426 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1358 aa  190  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1360 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1346 aa  189  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1347 aa  172  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1347 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1347 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1360 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1352 aa  154  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1262 aa  146  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1319 aa  139  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1377 aa  138  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1308 aa  135  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1325 aa  126  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  26.27 
 
 		 1184 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1184 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1224 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1206 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1224 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  24.39 
 
 		 1254 aa  119  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1226 aa  118  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1305 aa  116  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1291 aa  115  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  33.2 
 
 		 1283 aa  115  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1223 aa  116  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1312 aa  115  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1290 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1224 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  27.46 
 
 		 1485 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  28.1 
 
 		 1273 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1273 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  27.01 
 
 		 1485 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  28.88 
 
 		 1382 aa  113  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  25.98 
 
 		 1342 aa  111  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1340 aa  110  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1229 aa  108  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  27.03 
 
 		 1285 aa  105  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  27 
 
 		 1232 aa  105  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  27.25 
 
 		 1246 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  27.25 
 
 		 1285 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  28.42 
 
 		 1025 aa  103  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1221 aa  102  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1221 aa  102  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1218 aa  101  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1310 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  26.38 
 
 		 1249 aa  100  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1265 aa  99.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1423 aa  99  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1299 aa  98.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1256 aa  98.6  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1254 aa  98.2  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1270 aa  97.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1344 aa  97.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  25.2 
 
 		 1344 aa  97.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1344 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1773 aa  97.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  27.6 
 
 		 1448 aa  96.3  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1259 aa  96.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1341 aa  96.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1304 aa  94.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1174 aa  94.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1328 aa  93.2  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1174 aa  92.8  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1550 aa  92.4  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1500 aa  91.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1297 aa  89.4  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1255 aa  89  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1305 aa  88.6  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1319 aa  88.2  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1259 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1259 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>