148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2678 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  100 
 
 		 1501 aa  2941    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  44.37 
 
 		 1276 aa  595  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  41.48 
 
 		 1276 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  41.48 
 
 		 1276 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1515 aa  469  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1510 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1578 aa  452  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  34.61 
 
 		 1084 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1206 aa  344  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  36.51 
 
 		 1335 aa  284  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  34.85 
 
 		 1538 aa  241  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1869 aa  238  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1550 aa  225  6e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1404 aa  224  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  33.49 
 
 		 2140 aa  211  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  33.25 
 
 		 2032 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1451 aa  198  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1428 aa  191  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  30 
 
 		 1441 aa  183  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1489 aa  181  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  29.96 
 
 		 1463 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1463 aa  171  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  30 
 
 		 1530 aa  162  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  32.14 
 
 		 1424 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  31.28 
 
 		 1398 aa  154  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1500 aa  151  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  27.04 
 
 		 1405 aa  151  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1448 aa  149  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1462 aa  140  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1392 aa  138  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1396 aa  134  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  32.03 
 
 		 1937 aa  131  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1783 aa  127  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1487 aa  125  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  27.65 
 
 		 1448 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1423 aa  121  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1270 aa  118  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1362 aa  115  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.96 
 
 		 1395 aa  102  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  27.81 
 
 		 1550 aa  94.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1352 aa  77.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  31.12 
 
 		 1285 aa  73.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1308 aa  67  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1218 aa  65.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  22 
 
 		 1256 aa  65.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1206 aa  65.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1056 aa  64.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1434 aa  65.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1224 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1325 aa  64.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1224 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1505 aa  63.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1361 aa  63.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1283 aa  63.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1304 aa  62.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1223 aa  62.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1346 aa  62  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1297 aa  62  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1401 aa  61.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1273 aa  60.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  27.78 
 
 		 1246 aa  60.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1292 aa  60.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1221 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  30.58 
 
 		 1273 aa  60.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.1 
 
 		 1243 aa  59.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1221 aa  59.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  26.42 
 
 		 1025 aa  59.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1319 aa  58.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1232 aa  58.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1453 aa  58.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  23.24 
 
 		 1705 aa  58.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  26.15 
 
 		 1285 aa  57.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  28.9 
 
 		 1359 aa  57.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1290 aa  57.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  25 
 
 		 1344 aa  56.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1473 aa  56.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  25 
 
 		 1341 aa  56.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1224 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1443 aa  56.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1340 aa  55.5  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1299 aa  55.5  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1302 aa  55.5  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1262 aa  55.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1453 aa  55.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1310 aa  55.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1380 aa  54.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1344 aa  54.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1344 aa  55.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  27.43 
 
 		 1378 aa  53.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  24.8 
 
 		 1443 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1305 aa  53.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1265 aa  53.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1319 aa  53.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  28.5 
 
 		 1342 aa  53.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1290 aa  53.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1369 aa  52.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1254 aa  52.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1319 aa  52.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  24.74 
 
 		 982 aa  52.4  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  27 
 
 		 1249 aa  52.4  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>