135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2904 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1937 aa  3661    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1783 aa  466  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  35.22 
 
 		 1550 aa  282  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  42.15 
 
 		 1500 aa  195  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  37.55 
 
 		 1428 aa  156  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1395 aa  154  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1462 aa  147  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  25.62 
 
 		 1448 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  30.27 
 
 		 1405 aa  142  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  33.84 
 
 		 1423 aa  142  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  34.87 
 
 		 1451 aa  139  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  34.62 
 
 		 1463 aa  136  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1463 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  43.67 
 
 		 1398 aa  133  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  34.23 
 
 		 1441 aa  132  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1869 aa  132  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  33.97 
 
 		 1392 aa  130  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1538 aa  127  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1515 aa  126  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  37.36 
 
 		 1396 aa  126  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1510 aa  125  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1578 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1406 aa  123  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1550 aa  123  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  43.03 
 
 		 1530 aa  123  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1404 aa  122  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1276 aa  122  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1276 aa  122  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1448 aa  122  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  30 
 
 		 1084 aa  120  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  32.24 
 
 		 2140 aa  119  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  32.83 
 
 		 1270 aa  118  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  33.05 
 
 		 2032 aa  118  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1276 aa  115  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1501 aa  112  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  39.39 
 
 		 1489 aa  112  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1362 aa  108  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1487 aa  108  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1319 aa  103  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1206 aa  97.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  39.05 
 
 		 1424 aa  91.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1256 aa  79  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1218 aa  76.3  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1434 aa  75.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1505 aa  75.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1377 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  27.09 
 
 		 1243 aa  73.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1443 aa  70.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1335 aa  68.6  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  25.12 
 
 		 1507 aa  68.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  26.45 
 
 		 1507 aa  67  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1325 aa  65.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1453 aa  65.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1292 aa  64.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1352 aa  64.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1332 aa  63.9  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1504 aa  63.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1304 aa  62.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1361 aa  62.4  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.69 
 
 		 1359 aa  61.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.79 
 
 		 1485 aa  61.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1056 aa  61.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1401 aa  60.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1346 aa  60.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  27.43 
 
 		 1246 aa  60.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1473 aa  59.7  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1308 aa  58.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.72 
 
 		 1273 aa  58.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1273 aa  58.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1392 aa  57  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1380 aa  57  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  22.98 
 
 		 1485 aa  56.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  25 
 
 		 1378 aa  56.2  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  24 
 
 		 1515 aa  55.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  21.62 
 
 		 1285 aa  53.5  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1283 aa  53.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1297 aa  52.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  29.14 
 
 		 1249 aa  52.8  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1346 aa  52.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1358 aa  52.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1184 aa  52.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  26.64 
 
 		 1184 aa  52.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1448 aa  52.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1360 aa  52.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  25 
 
 		 1426 aa  52  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1259 aa  51.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1372 aa  50.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1174 aa  51.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  27.16 
 
 		 1304 aa  51.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  30 
 
 		 1255 aa  51.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1372 aa  50.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1259 aa  50.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1259 aa  51.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1259 aa  50.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1259 aa  50.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1372 aa  50.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1372 aa  50.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1372 aa  50.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1372 aa  50.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1372 aa  50.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>