145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0874 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  41.16 
 
 		 1530 aa  935    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 1489 aa  2900    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  38.61 
 
 		 1424 aa  894    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  42.37 
 
 		 1448 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  88.92 
 
 		 1487 aa  2520    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  42.88 
 
 		 1441 aa  1010    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  42.19 
 
 		 1463 aa  985    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  41.44 
 
 		 1451 aa  963    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  42.26 
 
 		 1463 aa  988    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  33.29 
 
 		 1428 aa  612  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  32.13 
 
 		 1423 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1404 aa  343  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1869 aa  316  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  33.09 
 
 		 2140 aa  270  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  31.23 
 
 		 2032 aa  257  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1515 aa  248  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1510 aa  247  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1538 aa  226  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1578 aa  226  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1276 aa  211  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1276 aa  211  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1276 aa  211  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  30.88 
 
 		 1500 aa  201  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1319 aa  194  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1550 aa  188  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1462 aa  187  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1395 aa  180  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  27.6 
 
 		 1448 aa  174  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1501 aa  172  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1335 aa  158  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1206 aa  156  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  27.94 
 
 		 1084 aa  154  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  22.57 
 
 		 1405 aa  152  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1396 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1783 aa  135  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1398 aa  134  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1392 aa  133  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  39.39 
 
 		 1937 aa  112  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1362 aa  111  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  24.43 
 
 		 1550 aa  108  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1308 aa  102  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1406 aa  101  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1232 aa  96.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1270 aa  92.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1223 aa  89  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1224 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1229 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1443 aa  82.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1206 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1221 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1226 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1256 aa  79.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1221 aa  79.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1377 aa  78.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1224 aa  77.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1224 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1226 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  23.55 
 
 		 1184 aa  74.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1184 aa  74.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1255 aa  73.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1473 aa  73.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1304 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1292 aa  72  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25.91 
 
 		 1243 aa  71.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1352 aa  69.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23.79 
 
 		 1285 aa  69.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  24.56 
 
 		 1705 aa  68.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1453 aa  68.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  25.75 
 
 		 1443 aa  68.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  24.69 
 
 		 1378 aa  68.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1358 aa  68.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1360 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1297 aa  67  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1346 aa  67  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  27.76 
 
 		 1359 aa  65.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1218 aa  65.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  24.44 
 
 		 1285 aa  64.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1448 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  22.17 
 
 		 1273 aa  63.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1435 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  21.15 
 
 		 1344 aa  63.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1344 aa  63.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1401 aa  63.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1341 aa  63.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1344 aa  63.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1273 aa  63.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1262 aa  62.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1319 aa  61.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1317 aa  59.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1259 aa  58.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1380 aa  58.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1325 aa  58.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1385 aa  58.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1347 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1347 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  24.3 
 
 		 1426 aa  57.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1347 aa  57.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1360 aa  57  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1375 aa  57  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1369 aa  57  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>